第一次忍界大战大大加深了五大国之间的隔阂，在忍者们心中留下了长久不能抹平的伤疤与仇恨，虽然这是历史的必然产物，但第一次忍界大战是之后五大国互相厮杀的重要原因之一。
第一战的结果造成了水土两国，云火两国的深切仇恨。
第二次忍界大战是由风、岩和木叶战斗。当时三代风影号称最强风影，给了风隐村底气。
当时事件的导火索是位于风火土三国中间的小国——雨之国。
此时雨隐村的村长是有“忍者半神“之称的山椒鱼半藏，虽为小国但却有不亚于三大国的武力。四国的矛盾冲突激化，终于由火之国挑起事端，与雨之国开战，第二次忍界大战开始。
这场战斗其中有团藏的影子，因为在一战中让猿飞日斩继承了三代火影，团藏其实心里有点不满的，所以可能是想接着这个战争除掉三代？
开战后，木叶忍者大举攻入雨之国，雨之国沦为了战场。战争中雨之国民流离失所，许多人在战争中丧生，漩涡长门的父母被木叶忍者误杀，长门成为了孤儿，种下了对木叶的仇恨。
随后，风之国和土之国也向雨之国开战，砂隐村和岩隐村忍者也攻入了雨之国。火雨两国是最先交战的，山椒鱼半藏在当时几乎是忍界巅峰水平的实力，与木叶的战斗中未有败绩。自来也、纲手、大蛇丸也被木叶派往雨之国战场，三人也与半藏交战不敌，但三人不俗的战力和绝不放弃的精神使半藏生出惜才之情，因此被留住性命，还得到“三忍“的名号，可谓一战成名。
虽然没能战胜半藏，但木叶整体实力胜过雨隐村，而且雨隐还同时面对风之国和土之国两大强敌。最终，两国以木叶胜出而签订停战条约，木叶忍者撤出战场。在木叶忍者陆续撤离过中，发生了一段小插曲，三忍偶然相遇长门、弥彦、小南三个孤儿。自来也出于歉疚和怜悯，决定独自留下照顾并教导他们。
雨之国与火之国打的时候，风土两国想趁火打劫，攻击雨之国，名义上是帮助木叶。
但是雨之国和火之国通过协商停战了。
之后雨之国和风土两国打，火之国坐山观虎斗，这让风土两国很生气。风之国一向是火之国的盟友，火之国这个做法让风之国很生气，于是风之国和火之国开战。
风之国和雨之国停战，木叶和砂隐开战。
期间，砂隐村的忍者在战场中使用千代婆婆的毒药进行战斗，已经成名的纲手和大蛇丸被派往战场，纲手以出色的医疗忍术破解了毒药。千代研毒用毒，纲手研毒解毒，两人在战场上以医疗忍术进行了一场别开生面的对决，最终纲手解毒更胜一筹。此战中，纲手作为医疗忍者大放异彩，“医圣“的地位由此奠定。除了纲手，木叶上忍旗木佐云也在战场上立下赫赫战功，因其手持散发白光的查克拉短刀而被人称为“木叶白牙“。千代婆婆的儿子和儿媳也在此战的一次任务中，被其所杀。
虽然，火之国在战争中始终稍占上风，但是仍无法一举击溃风之国，而成为一场持久战。随着战争伤亡的增加，战场规模的不断扩大，两国对战力的使用激增。年幼的下忍也作为战力，开始被派往战场执行任务。纲手的弟弟千手绳树、宇智波美琴、漩涡玖辛奈、波风水门等从木叶的忍者学校毕业后，也踏入战场。
这场战争造成了蝎父母的死，让蝎对木叶有了很深的仇恨，这也是蝎之后偷袭三代风影杀了他的原因。
自号最强风影，却徒具虚名，让砂隐蒙受屈辱，蝎就把他杀了。
风火两国的战争持续了数年也还没结束。雷之国也在期间对火之国有过战斗，云隐村的忍者在战场中发现了漩涡玖辛奈的特别之处，随后趁木叶村空虚之时，潜入木叶掳走了玖辛奈。
在逃回云隐的途中，因波风水门发现了玖辛奈留下的标记而暴露了行踪，最后在火之国边境线附近被波风水门击杀。玖辛奈因此获救，木叶差点失去了九尾。这次事件如果九尾被夺，尾兽平衡一旦打破，木叶甚至会因此灭亡。所幸的是，波风水门及时发现并救出了玖辛奈。
此战，纲手的弟弟和恋人接连丧生，让她伤心欲绝，甚至得了晕血症，不想再成为医疗忍者从而远走他乡，开始了二十年的沉沦。
虽然风火两国的战争，火之国胜利，风之国签订了屈辱的同盟协定。
但是土之国对于火之国的仇恨依然在。随着木叶与国境附近的小国与忍者村的战争而抽掉大量军力布守前线的时候。
岩隐村派出逾千名忍者，穿过草忍者村对木叶进行突袭。
其中最重要的一战是神无毗桥之战。在第三次忍界大战中，木叶高层命令水门率领队员旗木卡卡西、野原琳、宇智波带土去破坏敌方岩隐村的补给要道神无毗桥。当时正值卡卡西晋升上忍之日，水门将带有飞雷神术式的苦无送给卡卡西做礼物。
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