属隶各大岛总督府指挥，包括苏门答腊岛、爪哇岛、苏拉威西岛、加里曼丹岛、巴厘岛及新几内亚岛，设有守备部队，包括陆军一个师（一万人以上，乙级师）、海军陆战旅（三千人以上）、海军巡航舰分遣舰队，共六支部队。
其中每支分遣舰队有15艘六级巡航舰，按照海军规定，和平时期，每艘战舰一个标准的训练、执勤和休整周期为18个月，并各占1／3时间。因此，正常情况下，战舰执勤或担负作战任务，1／3进行海上训练，另有1／3在港内休整或进厂维修保养。
当然，战时其训练、休整和维修周期会缩短，能执行作战任务的战舰将比平时增加50％至1倍左右，需要时所有的战舰都投入作战中。
这是家大业大后才能够做到的操作，否则你才拥有几条战舰，三分之一用于巡逻，喏大的海面连只帆影都没有。
没有足够的力量在海域上巡逻，休怪别人多想了。
再有，木制军舰不停地使用，不作保养的话，很快就会海底长满了东西以致于以龟速前进，又或者船蛆把船底蚀穿，那就亏大本了。
话又说回来，军舰还是少，如进行海上训练的军舰其实也是执勤，见到不良情况一样要参与处理；同时，战舰执勤时照样要进行训练，只不过侧重点不同。
对于各大岛的完备部队的使用，需要有完备的手续，一是总参谋部的军令，二在紧急情况下，由总督、驻各岛的中央专员、军区指挥官同时签署军令方可调动军队，总参谋部的军令最优先。
但使用军队还是麻烦，不利于紧急情况的处理，因此组建了武装警察，他们装备不及军队，但调动手续则相对简单一些，训练归军队指挥，使用归总督。
二、东南府直属陆军部队。
甲类师，每个师达一万三千到五千人，装备最好，火力最强，拥有6磅和12磅的重型行军炮（乙级师的炮少）及后装燧发枪（乙级师还没装备这种枪），这样的师有六个；
三、海军陆战队。
六个陆战旅，每个旅有三千人以上。
四、后备役部队。
这是最庞大的部队，所有的十六岁到六十岁以上的、身体可行的男丁，尽为预备役。
六、海军作战部队。
东南府军队的精华所在，核心部队。
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