四十四年初，淮安道王谦弹劾山安同知佟世禄，冒领治河工程款耽误了治理黄河的进度，张鹏翮下令将佟世禄撤职并且追讨贪污款项。
佟世禄进京告御状，经查明，佟世禄贪污一事为子虚乌有，皇上命令徐潮详细调查此事，发现此事是王谦诬陷佟世禄，而张鹏翮听信一面之词处理了佟世禄。
大臣纷纷要求惩办张鹏翮，皇上信任张鹏翮的人品和能力，宽恕了他。
而后南巡时，发现黄河水倒灌，张鹏翮谎称并未倒灌，被皇上斥责有巧饰用词，推卸责任，怠忽玩工之嫌，告诫他治河工事不是能一蹴而就的，一两年后才方见成效，还是尽力完善为好。
五月，工部侍郎赵世芳上奏折，议张鹏翮奏销钱粮浮冒13万余两，应交刑部治罪。
供应治河人员的钱粮原本是不限数的，洪水凶猛的时候需要的就多，水位稳定的时候所需就少。
皇上因对张鹏翮的清廉较为了解，十分宽宥，认为张鹏翮私吞的事必定不存在，是治河人员仗张鹏翮的势才有这样的说法。
皇上虽然相信张鹏翮的清廉，但是，对于对张鹏翮举荐、任用王谦、张弼等人十分不满。
训斥他之所以被王谦那种小人所欺骗，是因为他用人听事过于刻薄，也流于表面，往往他人一有做错事的口实就加以追责，也因此冤枉佟世禄那样的好人。
今年又出了溜淮套的事情，还能留任，也是皇恩浩荡。
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