暗区里一些主要人员架构就是这样，而卡莫纳南北战争爆发的原因，则是因为一个苏梅尔计划导致的。
南北战争爆发后，自由阵线渐渐显现颓势(从战争后期政府军反攻山谷一带就能看出来)，于是就启动了暗区里至今热议，也是探讨暗区剧情最绕不开的话题——冈格尼尔计划。
冈格尼尔（Gungnir）是北欧神话中主神奥丁所使用的武器。由矮人们用世界树（Yggdrasil）的树枝打造而成。本身的原型是标枪，所以作为投枪使用，威力巨大，可穿透一切，投射时宛若流星划破天际，又名流星之枪。而自由阵线以“冈格尼尔”给计划命名，就说明很有可能，这种武器能够左右卡莫纳南北战争的走向(很多人都说这是一枚大威力核弹，但是核弹至于让卡莫纳政府大动干戈吗，别忘了卡莫纳政府背后的北方安全联合也不是吃素的，一枚核弹应该不至于引发后来北方军那么大的反应)。
而当时负责驻守前线要塞的是阿贾克斯，也就是后来乔木镇农场的场长。在雷诺伊尔率军解除了前线要塞附近的南方军包围后，南方军队在紧急从要塞周边撤出之时，情报显示他们护送了一个神秘车队，而这个车队正运输与“冈格尼尔计划”有关的一系列设备和文件。
情报显示他们会经过农场的立交桥。果然不出所料，车队经过了农场，阿贾克斯奉命炸毁了桥梁，车队被拦截，所有护送的人员命丧于阿贾克斯及其小队手下。而与冈格尼尔计划有关的机密文件则不知所踪。
(根据游戏内的实景，被阿贾克斯炸毁的桥梁和车队，可以看到上面有类似火箭发动机元件的设备。综合百度查找的剧情资料，再综合北方阵线面对冈格尼尔计划的反应，可以推测出推测“冈格尼尔”大概率是一种“天基武器”，类似于“上帝之杖”这种天基动能武器。)
而当冈格尼尔计划因为农场事件被曝光后，各大域外势力纷纷对冈格尼尔计划的机密文件感兴趣，而此时这种大规模杀伤性武器的计划也惊动了苏梅克委员会（可能是类似于现实世界中联合国的中立性国际机构），于是苏梅克委员会以“威胁和平”为由，介入了卡莫纳南北战争并进行调停，宣布双方必须立即停火并接受“国际上对于冈格尼尔事件的调查”
由于担心这种绝密计划泄露带来的影响，苏梅克委员会只进行了简单的疏散后，就联合南北双方的高层，对这片交战区进行“封锁”。暗区，就此形成，从马尔洛斯平原到欧特斯山脉，几乎横亘卡莫纳这个国家的中央。
(以上就是暗区突围游戏大部分剧情，剩下的，譬如说黑金国际，白狼联队以及那些联络人，后面会单独再出一期)
然后是明日之后。
明日之后这个就好多了，毕竟官方出过《明日编年史》还有《101档案馆》等一系列剧情公布，加上各大UP的分析，所以明日的剧情比较透明。
纪历1066年，南印洲克罗市，海姆达尔公司新品发布会，邀请了各界人士来试喝海姆达尔的最新饮品。而就是在喝下这批饮品后，诞生了世界上第一批感染者，也就有了后来的卡迪梅尔医院事件。
由于当地政府的处置不利，最开始没有人意识到这是一场席卷世界的灾难，等到共治政府反应过来后，病毒已经席卷了整个南印洲，并向西陆，南陆等地转移。
事不宜迟，共治政府立刻组织军队，成立特别军事部队ISR，负责进入感染区搜寻物资，并转移难民。同年，由于疫苗的研发失败，共治政府确定了以武力遏制感染潮的政策，感染战争爆发。
感染战争爆发初期，人类军队进展顺利，共治政府甚至提出了以首府城市，反攻南印洲为主的《迦南计划》，打算集中兵力收复主要城市。
但是好景不长，沃尔曼斯克战役，人类联合军大败，新式感染体的出现让人类的胜利瞬间变的虚无缥缈。沃尔曼斯克战役的失败，也宣告了感染战争的失败和《迦南计划》的破产。共治政府随即宣布启动方舟计划，密谋放弃大陆，退往方舟。
共治政府撤到方舟后，就彻底丧失了对大陆人类残余力量的控制。各种避难营，小营地如同雨后春笋一样发展起来，这就是自由贸易联盟的雏形。
而北方帝国，前身则是共治政府在金耀岛的坂良城避难所，在诺伦半岛避难所发生潜伏期感染者暴动后，坂良城宣布脱离《共济协议》，宣布独立，北方帝国雏形出现。
而科技会呢，则是在最后发动了政变，共治政府彻底垮台，形成了如今自由贸易联盟，北方帝国，科技会三方鼎力的局面。
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