此时，李昖大加赞赏当年义无反顾支持自己“内附”明朝的廷臣，向当年反对自己“内附”的廷臣发难。此时西人党的俞泓不断受到台谏弹劾，究其原因便是当年在“播迁”与“内附”事件中违背李昖意愿。
在李山海首倡北上“播迁”之时，俞泓表面极力反对，而暗地里却“令家人避兵而外”，李昖据此认为其人狡诈。而在“内附”之时，俞泓也表示希望跟随世子，他声称“臣已老矣，不得渡辽。从世子，恢复之后当迎驾而归”。
两件大事，此人都站在李昖的对立面，故李昖对俞泓已经是极尽厌恶。对于俞泓所言，李昖当时并未回复，但后来李昖曾批判俞泓“自行自止，殊无君臣之义”。紧接着，台谏便开始弹劾俞泓。
李昖曾询问都承旨柳根，道：“体察使俞泓论递云，其代，谁可为之？”紧接着十二月二十五，台谏便再次弹劾俞泓，又捱了一个月后，俞泓最终被夺职。
在功臣册封事件中，东人党的郑崐寿被册封为一等护圣功臣，南人党的柳成龙被册封为一等宣武功臣，而西人党成绩不佳，原来一党独大的优势宣告消失。究其原因，其实就是西人党在“内附”事件中始终站在李昖的对立面，以致于李昖重归汉阳后，立刻大力驱逐西人党官员。
再后来，西人党领袖郑澈去世，西人党要员尹斗寿不断遭遇司宪府、司谏院、弘文馆共同弹劾，南人党成员遂占据中枢各衙门，也即柳成龙成为领议政的那段时间。
不过，历史上南人党也并未得势很久，伴随着后来其领袖柳成龙被弹劾，北人党又掌握了大权。
如此朝政大权交换轮替，李昖并不是不能阻止，实因西人党与南人党先后极力反对李昖“内附”而遭到李昖厌恶，因此他最终选择扶植北人党——为什么是北人党？因为北人党领袖李山海曾首提“播迁”之事。
廷臣对于李昖“内附”事件的讨论，不仅使得朝鲜政治生态混乱不堪，君臣谏诤日益激烈，同时使得李昖与光海君的父子之间相互猜疑。
光海君为李昖与恭嫔金氏的第二子，因此在王位继承上缺少名分支持。李昖立光海君为世子有两个原因：一来是李昖的懿仁大妃并无嫡子；二来李昖当时一心一意只愿“播迁”，立光海君为世子可以分散廷臣的注意力。
而当李昖准备“内附”之时，便授意光海君分朝，命令光海君往江界组织军队进行反侵略活动。这样一来，既可以应对西人党成员不断施加的压力，又可以鼓舞士气，鼓励朝鲜百姓继续抗战。因此原历史上在大明派兵援朝后，李昖的“内附”便无疾而终。
在明军提督李如松收复平壤后，李昖迅速结束了分朝之事。其实李昖一直认为光海君并不是未来国王的最佳人选，只是他当时为实现“内附”而做的妥协。因此，在李昖回归汉阳后，大力驱逐积极靠拢光海君的西人党成员。
在壬辰战争结束后，光海君一直因为名分问题并未获得明朝的册封，李昖因此更希望更易世子人选，反过来又导致父子之间矛盾渐深。
李昖想立仁穆大妃之子永昌大君为世子，当时的领议政柳永庆等廷臣曾展开秘密讨论，商议是否可以将永昌大君立为世子。但是由于此时李昖突然离世，这一想法还未付诸实践，光海君就已即位。
即位后，光海君任用了李尔瞻等人，而李尔瞻为大北派领袖(这个有别于北人党)，在大北派的主导下，光海君之兄临海君被杀，李昖的仁穆大妃被废，仁穆大妃之父金梯男被杀，永昌大君被废为庶人，圈禁至江华岛，于万历四十二年年被江华岛府使郑沆杀死。
在光海君即位之后，朝政便由大北派掌控，此时西人党欲重夺政权，便发动了“仁祖反正”事件，并且最终重夺政权。
总之，“内附”事件使得朝鲜朝内党争不断发酵，而李昖“内附”过程分为两个阶段，第一阶段为“播迁”，在播迁途中，党争作用于“立世子”事件上，东人党与西人党大规模争论，最终东人党获胜，光海君被确立为世子。
“内附”的第二阶段便是对“播迁”方向的选择。此时，不同意“内附”的廷臣开始提出“世子分朝”的建议，“内附”事件直接促成了李昖与光海君分朝，李昖北上义州专为“内附”，光海君入江界安定人心、组织抗战。跟随光海君的廷臣实际上是坚决反对李昖“内附”的中坚力量。
在李昖回到汉阳后，大力驱逐西人党人士。因光海君为恭嫔金氏的第二子，并非李昖大妃的长子，并无资格继承王位，故在李昖弥留之际，欲更换世子，将仁穆大妃所生的永昌大君立为世子，当时小北派领袖柳永庆为此积极活动，此事还未完成，李昖便去世了。
此事造成李昖与光海君父子关系紧张，同时，光海君上台后开始疯狂打击报复，将永昌大君囚禁并处死、废除仁穆王后，启用大北派官僚李尔瞻等人。
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