与此同时，战场上的局势愈发危急。星际联邦的舰队损失惨重，神秘组织的战舰却越战越勇。艾丽莎看着不断减少的战舰数量，心中充满焦虑。就在这时，织影者突然说道：“我发现了他们能量核心的位置，在旗舰的底部，但那里防御严密，很难接近。”
凯尔斯毫不犹豫地站了出来：“让我的行动队去吧，我们擅长突袭。”他带领着行动队的精英成员，驾驶着小型穿梭机，朝着神秘组织旗舰的底部飞去。穿梭机在密集的炮火中穿梭，不断有队员的飞船被击中，爆炸产生的火光在黑暗的宇宙中闪烁。
陈宇在与黑袍人的战斗中逐渐落入下风，他的飞船多处受损，能源也即将耗尽。就在这时，星骸之眼的碎片突然发出强烈的光芒，一道金色的光柱从天而降，笼罩住了陈宇的飞船。在光柱的作用下，飞船的伤势开始快速修复，同时，陈宇的脑海中浮现出一段古老的记忆——那是卡文迪许家族先祖封印古神时的场景。
“原来如此，熵能圣殿不仅是封印古神的关键，也是唤醒古神的钥匙。”陈宇眼中闪过一丝明悟，他驾驶飞船冲破黑袍人的阻拦，冲进了熵能圣殿。圣殿内部，一个巨大的能量核心悬浮在空中，能量核心表面，古神的虚影若隐若现。
陈宇迅速操作飞船，发射出特制的能量束，试图摧毁能量核心。然而，能量核心却产生了强大的防护罩，将攻击反弹回来。与此同时，神秘组织的旗舰底部，凯尔斯带领的行动队成功突破防线，安置好了炸弹。随着一声巨响，旗舰底部被炸出一个大洞，能量核心的防护罩也出现了一丝裂痕。
抓住这个机会，陈宇将星骸之眼碎片的全部力量注入能量束，再次发动攻击。这一次，能量束成功突破防护罩，击中了能量核心。能量核心剧烈颤抖，古神的虚影发出愤怒的咆哮。神秘组织的舰队感受到能量核心的危机，纷纷放弃战斗，朝着熵能圣殿赶来。
艾丽莎抓住这个机会，下令舰队全力追击。星际联邦的舰队与神秘组织的残余势力在熵能圣殿外围展开了最后的决战。织影者也加入战斗，她的数据体化作无数道流光，穿梭在敌舰之间，进行精准打击。
在能量核心即将被摧毁的关键时刻，影刃突然出现。他驾驶着一艘经过改造的超级战舰，战舰上装备着强大的武器系统。“你们以为这样就能阻止古神的复苏吗？太天真了！”影刃疯狂地大笑，“古神的力量已经渗透到宇宙的每一个角落，就算摧毁这个能量核心，也无济于事！”
影刃的战舰发射出强大的攻击，击中了陈宇的飞船。飞船剧烈摇晃，陈宇受伤严重，但他依旧坚持操作飞船。“诗涵，我不会放弃的！”陈宇咬牙说道，他集中最后一丝力量，将星骸之眼碎片与飞船的能源核心融合，发动了最后的攻击。
一道耀眼的光芒闪过，能量核心终于被彻底摧毁。古神的虚影发出凄厉的惨叫，逐渐消散。影刃的战舰也在爆炸的余波中被摧毁，他本人生死不明。神秘组织的残余势力失去了主心骨，纷纷投降。
战斗结束后，艾丽莎带领众人进入熵能圣殿。他们发现，在能量核心被摧毁后，圣殿内的古老符文发出了柔和的光芒，这些光芒逐渐汇聚成一个巨大的屏障，将银河系中心星域包裹起来，防止古神的力量再次渗透。
陈宇在飞船残骸中被救出，虽然身受重伤，但并无生命危险。他站在熵能圣殿的平台上，望着浩瀚的宇宙，心中默默说道：“诗涵，我们成功了，但我知道，这场战争还没有真正结束。只要古神的威胁还存在，我们就不能松懈。”
在之后的日子里，星际联邦开始了大规模的重建工作。艾丽莎推动议会通过了一系列新的法案，加强了对各个星系的管理，防止类似卡文迪许家族的事件再次发生。织影者选择留在星际联邦，利用自己的能力帮助人类发展科技。凯尔斯的行动队继续在宇宙中巡逻，守护着来之不易的和平。
然而，在宇宙的某个未知角落，一双巨大的眼睛再次睁开。古神的声音在虚空中回荡：“蝼蚁们，你们以为这就是结局了吗？真正的游戏，才刚刚开始……”暗潮涌动，新的危机正在悄然逼近，银河系的命运，又将何去何从？
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