灵枢和素问开始运用所学的医学知识，对病人进行诊断和治疗。他们尝试了各种方法，针灸、草药、推拿，但病人的病情却没有丝毫好转。时间一分一秒地过去，灵枢和素问的额头布满了汗珠，他们的心中充满了焦虑。然而，就在他们感到绝望时，灵枢突然想起了昨晚在古籍中看到的一段记载，关于一种古老的治疗方法，或许可以一试。
灵枢对素问说道：“素问，我想起了一种古老的治疗方法，或许能救这位病人。但这种方法从未实践过，风险极大。” 素问坚定地说道：“师兄，如今已无他法，哪怕只有一线生机，我们也要试一试。为了完成使命，哪怕付出一切代价。” 灵枢点了点头，开始准备治疗所需的物品。他从医箱中取出一根特制的银针，这根银针是他多年前在山中采药时偶然所得，据说具有神奇的功效。他又调配了一种特殊的草药汁，将银针浸泡其中。
一切准备就绪后，灵枢手持银针，缓缓刺入病人的穴位。随着银针的刺入，病人的身体微微颤抖了一下，灵枢的额头也冒出了细密的汗珠。他小心翼翼地转动着银针，同时观察着病人的反应。素问在一旁紧张地注视着，手中紧紧握着药汁，随时准备配合灵枢。
过了许久，病人的面色逐渐有了一丝红润，呼吸也变得平稳起来。灵枢和素问心中一喜，知道治疗有了效果。他们继续按照古老的治疗方法进行操作，又过了一段时间，病人缓缓睁开了眼睛。秦始皇看到病人苏醒，大喜过望，说道：“好！好！你们果然医术高超。朕定会重赏你们。”
灵枢和素问通过了黑袍人的考验，他们在咸阳宫的地位也因此得到了极大提升。秦始皇对他们愈发倚重，不久后，便命他们着手建立宫廷御医体系，维护官员们的健康。
灵枢和素问深知，此事责任重大，关乎大秦帝国的朝堂稳定。素问皱着眉头，忧心忡忡地对灵枢说道：“师兄，这宫廷御医体系的建立，绝非易事。宫中官员众多，病症繁杂，且各有各的背景，稍有不慎，便可能引发诸多麻烦。但既然肩负着守护陛下及朝堂的使命，我们定要全力以赴。” 灵枢神色凝重，微微点头，回应道：“素问所言极是。不过，这也是我们践行使命、造福朝堂的契机。我们需从长计议，制定周全之策。”
二人首先对咸阳宫原有的太医资源进行了全面梳理。他们发现，这些太医虽各有所长，但医术水平参差不齐，且缺乏统一的诊疗规范和知识体系。为改变这一现状，灵枢和素问决定先从培训入手。他们在宫中设立了专门的太医研习所，召集所有太医，开始系统地传授医学知识。
灵枢手持一卷古老的医书，站在研习所的讲台上，目光扫过台下的太医们，语重心长地说道：“医道乃仁术，关乎生死。诸位身为宫廷太医，责任重大。从今日起，我们将一同研习经典医籍，探寻医道真谛。” 他详细讲解着人体经络的奥秘，配合着墙上悬挂的经络图，生动形象地阐述气血运行的规律。素问则在一旁演示针灸手法，她手法娴熟，精准地刺入穴位，一边操作一边说道：“这针灸之术，讲究的是精准定位、施力恰当。诸位务必勤加练习，方能在救治病人时发挥效用。”
然而，培训并非一帆风顺。有些太医习惯了以往的诊疗方式，对灵枢和素问传授的新方法心存疑虑。一位年长的太医站出来，微微躬身，说道：“二位神医，我等行医多年，向来依照祖上传下的法子治病，这新的理论和手法，真能有奇效？” 灵枢微微一笑，耐心解释道：“前辈，医道亦需与时俱进。我等所讲之法，皆有古籍记载，且经我二人多年实践验证。就如那扁鹊，不拘泥于旧法，方能成为一代神医。若我们墨守成规，又怎能应对复杂多变的病症？” 在灵枢和素问的耐心劝说下，太医们逐渐放下成见，开始认真学习。
为了让太医们更好地掌握新的医学知识，灵枢和素问还组织了多次病例研讨。他们挑选了宫中患有不同病症的官员，让太医们分组诊断治疗，然后共同探讨治疗方案的优劣。在一次针对一位患有消渴症官员的研讨中，一组太医主张以清热泻火之法治疗，另一组则认为应从滋阴补肾入手。双方各执一词，争论不休。灵枢和素问静静地听着他们的辩论，待双方陈述完毕，灵枢缓缓开口：“消渴症，病因复杂，既有燥热之象，亦有阴虚之症。诸位所言皆有道理，但需综合考量病人的体质、病情发展阶段等因素。清热泻火可解当下之急，滋阴补肾则是固本之策，二者应相辅相成。” 经灵枢这么一分析，太医们恍然大悟，对病症的理解更加深入。
除了培训太医，灵枢和素问还对宫廷的药材管理进行了整顿。他们发现，宫中的药材库管理混乱，药材品质参差不齐，甚至有些药材因保存不当已经变质。素问对此十分痛心，她对负责药材管理的官员说道：“药材乃治病之本，若品质不佳，如何能治愈病人？从今日起，需对药材库进行全面清查，严格筛选药材，按照药性、产地、采集时间等分类存放，确保药材的质量。” 在灵枢和素问的监督下，药材库进行了大规模的清理整顿，建立了完善的药材管理制度，每一味药材都有了详细的记录和严格的出入库流程。
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