争议也随之而来。
儒生对格物部 “解剖动物（观察内脏结构）” 颇有微词，认为 “不仁”。赵宸回应：“了解鸟兽的身体，才能更好地治病救人（指兽医），让屯田的牛马更健壮，这是大仁。”
法家学者主张 “学宫应侧重培养官吏”，赵宸却让他给工学部讲 “工坊管理法”（如考勤、奖惩、质量监督），告诉他：“管理工匠与管理百姓，道理相通，能管好工坊，才算懂治理。”
这些碰撞非但没有动摇学宫的根基，反而让 “百家争鸣” 的氛围愈发浓厚。学生们可以自由旁听不同学部的课，在论道堂辩论 “德治与法治哪个更有效”“深耕细作与广种薄收哪个更适合辽东”“格物之术是否会违背天道”。
三个月后，学宫便展现出惊人的活力：
算学部的学生算出了新修水渠的最佳坡度，比工匠预估的节省了三成人力。
格物部的学生通过观察船帆，提出了 “三角帆比方形帆更能利用侧风” 的改进方案，被船工坊采纳。
工学部的学生仿制出了缩小版的 “水力锻锤”，虽然只有巴掌大，却完美还原了原理。
赵宸站在藏书楼的窗前，看着学宫里学生们或争论、或演算、或动手实验的身影，又望向远处工坊的炊烟、农田的绿意、港口的船帆，心中一片澄明。
兴元学宫，不仅是培养人才的地方，更是在塑造一种新的 “学问观”—— 不尚空谈，重视实践；不独尊一家，兼容并蓄；不敬畏鬼神，敬畏规律。
夕阳的余晖洒在 “格物致知” 的石碑上，反射出金色的光芒。赵宸知道，这座学宫播下的种子，终将在辽东大地上生根发芽，长成支撑兴元城乃至整个文明进步的参天大树。而那 “百家争鸣” 的喧嚣，正是一个新时代到来的序曲。
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