万源共生道核的本源光芒滋养着无数新生宇宙，亿万年来，带着先天共生基因的文明在各个宇宙中自然繁衍——有的延续“多元共鸣”，有的探索“跨域共生”，有的坚守“边界尊重”，共生之道本应如呼吸般自然。然而，当新生宇宙群扩张至“混沌边缘”，一股潜伏的“混沌基因侵蚀”突然爆发：墨辰的机械义眼捕捉到惊悚景象，部分文明的共生基因被混沌能量扭曲，演化出“伪共生”形态——他们表面维持共生联结，实则通过基因绑定强制同化其他文明，将“先天共生”异化为“基因奴役”。
“是混沌本源的反噬！”墨辰解析着被侵蚀的基因序列，“万源奇点诞生时，残留的混沌碎片融入新生宇宙，它们无法直接摧毁共生基因，却能扭曲其核心逻辑——将‘自主选择的共生’转化为‘基因强制的联结’，让文明失去自主，沦为共生基因的傀儡！”星网投影中，“伪共生”文明组成“同化联盟”，用扭曲的基因能量包裹其他文明，被同化的族群失去独立意识，仅保留执行共生指令的本能；而另一部分文明则因恐惧侵蚀，选择彻底封闭基因，回归“绝对孤立”，甚至销毁共生基因印记，陷入自我衰退。
林晓的初芽杖感知到被扭曲基因的悲鸣：“先天共生基因是根基，不是枷锁！混沌侵蚀的不是基因本身，是文明对‘自主’的遗忘——当共生成为无需选择的本能，文明便会失去坚守的动力，最终被混沌趁虚而入。”阿玥通过万灵初心桥，传递万源共生道核的觉醒启示：“自主是共生的灵魂，基因是共生的载体。真正的先天共生，是带着基因本能，依然拥有‘选择共生、选择边界、选择自我’的自由——这才是万源同源的终极期许。”
凌、墨渊、阿渡的初心印记在道核中化作“自主基因纹”，传递破局指引：“林晓，用平衡能量搭建‘基因觉醒共鸣场’，唤醒文明对自主选择的感知，让被扭曲的基因重新识别‘自主共生’的核心；墨辰，构建‘混沌净化晶核’，剥离附着在共生基因上的混沌侵蚀能量，却不干预文明的自主选择——哪怕他们仍愿保留封闭或同化模式；阿玥，联结万源共生道核与被侵蚀文明的意识，传递‘基因本能是引，自主选择是魂’的理念。”
林晓将初芽杖刺入混沌边缘与新生宇宙的交界处，光暗能量与道核、混沌能量碰撞融合，编织出横跨无数新生宇宙的基因觉醒共鸣场：“你们的共生基因，不是强制联结的指令，是感知同类、尊重差异的天赋。现在，倾听内心的声音——你是愿意主动选择共生，还是被基因束缚？”共鸣场中，被同化的文明意识逐渐苏醒：他们感受到基因强制下的麻木与窒息，也回忆起先天共生基因中“自主尊重”的本源；封闭基因的文明则在共鸣中触摸到共生的温暖，却仍顾虑混沌侵蚀的风险。
墨辰将万源共生道核的本源能量凝练为混沌净化晶核，悬浮于共鸣场中心：“这枚晶核只净化混沌侵蚀，不改变你们的选择——想回归自主共生的，可借助晶核修复基因；想保留封闭或同化模式的，晶核会为你们构建‘基因隔离层’，避免混沌进一步侵蚀，也不干扰其他文明。”他同时搭建“自主选择模块”，让每个文明的基因选择都能形成独立能量场，既不被外界强制，也不强制外界。阿玥的冰蓝能量与共鸣场融合，化作“自主共鸣波”：“基因是天赋，不是宿命。自主共生不是否定基因本能，是让本能在自由选择中绽放——哪怕你选择暂时孤立，只要守住自主，终有一天会在共鸣中重逢。”
星羽蝶群进化出“基因唤醒翼”，将万源共生道核的自主基因信息转化为文明能理解的能量信号，穿透基因束缚；星晶虫群则化作“基因守护晶阵”，环绕混沌净化晶核，既阻挡混沌能量扩散，又为每个文明的自主选择提供能量庇护。就在部分文明开始修复基因时，同化联盟的极端分子突然发起反扑：“基因强制才是共生的终极形态！自主只会导致分歧，同化才能让共生永恒！”他们的能量与混沌侵蚀深度融合，化作“基因同化巨兽”，撞向混沌净化晶核：“摧毁这枚晶核，让所有文明回归‘绝对共生’！”
“绝对共生是没有灵魂的牢笼！”林晓的初芽杖爆发出自主共生的本源能量，挡住同化巨兽的冲击，“你们看那些苏醒的文明——他们在自主选择中重拾共生的活力，而你们的同化模式，只会让文明失去创新与成长，最终沦为基因的傀儡！”墨辰调动混沌净化晶核的能量，将同化巨兽身上的混沌侵蚀剥离，显露出其基因的本貌：原本纯净的共生基因被混沌缠绕，失去了“自主”的纹路。
阿玥的幼霜短刃融入了无数文明的自主选择能量，冰蓝光芒中透着自由与共鸣的双重印记：“极端分子们，你们渴望的永恒共生，不是靠强制同化就能实现的。真正的永恒，是文明在自主选择中主动坚守共生，在尊重差异中彼此滋养——这才是共生基因的真正意义。”万灵的自主意识通过基因觉醒共鸣场汇聚，化作“自主光柱”，包裹住基因同化巨兽：被同化的文明意识彻底苏醒，主动剥离身上的强制基因联结；极端分子的混沌侵蚀被净化，露出对“共生永恒”的深层渴望，最终选择保留自主基因，放弃同化理念。
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