由于存在这些疑点，湖北省高级人民法院将案件发回重审。然而，重审并没有带来预期的结果。1995年，佘祥林再次被判处死刑，但又因证据不足被高院驳回。案件陷入了"侦查-上诉-证据不足-继续侦查"的死循环。
五、漫长的申诉之路
在佘祥林蒙冤的日子里，他的家人承受了巨大的压力和痛苦。他的母亲杨武香在被关押9个月释放后，身体和精神都已被折磨得千疮百孔，眼睛也因为过度哭泣而几近失明。不久后，她便含恨离世，临终前眼睛始终没有闭上，因为她坚信儿子是清白的。
佘祥林的大哥佘锁林也因上访受到牵连，失去了预备党员身份和治保主任的职务，还被关押了41天。佘祥林的女儿在学校也遭受到了歧视和孤立，最终被迫辍学，14岁就跟着叔叔到深圳打工。
在狱中，佘祥林并没有放弃为自己洗刷冤屈的努力。他每天在繁重的劳动之余，都会趴在床边，用一支破旧的笔，在粗糙的纸上写下申诉材料。那些文字，饱含着他的冤屈、痛苦和对自由的渴望。他还记下了好几本日记，记录下在狱中的点点滴滴，包括狱友的帮助，自己对家人的思念，以及对未来的憧憬。然而这些申诉材料和日记如同石沉大海，没有激起一丝波澜。
1998年6月15日，京山县人民法院以故意杀人罪判处佘祥林有期徒刑15年，剥夺政治权利。佘祥林再次提出上诉，但荆门市中级人民法院驳回了他的上诉，维持原判。至此，佘祥林只能接受命运的安排，在监狱中度过漫长的15年。
六、"亡妻"归来
2005年3月28日，命运的转折出现了。一个令人震惊的消息传到了京山县雁门口镇：已经"死亡"11年的张在玉竟然活着回来了！她牵着现任丈夫的手，带着一个孩子，出现在了乡亲们面前。
原来，当年张在玉与佘祥林吵架后离家出走，由于精神疾病发作，她忘记了自己的身份和家庭住址。她一路流浪，最终来到了山东省枣庄市。在那里，她被一位好心的男子收留，两人结为夫妻并生下了一个孩子。随着时间的推移，张在玉的病情逐渐好转，记忆也开始恢复。她想起了自己的家乡和亲人，于是决定带着现任丈夫和孩子回老家探亲。
当张在玉回到家乡时，她完全不知道自己的"死亡"已经导致前夫佘祥林被判处15年有期徒刑。她的突然出现，让整个村庄炸开了锅。村民们议论纷纷，有人说这不可能，张在玉明明已经死了，村里很多人都看见过她的尸体；也有人说，这是佘祥林的冤屈感动了上天，让"亡妻"复活来证明他的清白。
张在玉的家人起初也不敢相信自己的眼睛。但经过仔细辨认和DNA鉴定，他们不得不接受这个事实：眼前的女子确实是他们以为已经死去11年的张在玉。
七、沉冤得雪
张在玉"死而复生"的消息很快传到了京山县人民法院。法院立即派人进行调查，并作了调查笔录。公安机关也及时通过DNA鉴定，证实了其身份，并向法院出具了证明，证实回来的女子确为张在玉本人。
面对这一铁的事实，京山县人民法院不得不重新审视佘祥林案。2005年3月30日，荆门市中级人民法院作出裁定，撤销原裁判，发回京山县人民法院重新审判。京山县人民法院重新组成合议庭，对佘祥林案件进行了公开开庭审理。
2005年4月13日，京山县人民法院作出判决，宣告佘祥林无罪。当法官宣布判决结果的那一刻，佘祥林泪流满面，11年的冤屈终于得以昭雪。走出监狱的佘祥林已是满脸沧桑，曾经的青春活力早已被岁月和冤屈消磨殆尽，身体也落下了病根，再也回不到从前。
佘祥林出狱后，首先去了母亲的坟前。他扑通一声跪在坟前，哭得泣不成声。他告诉母亲，自己终于被证明是清白的，她的坚持没有白费。
八、国家赔偿与后续生活
佘祥林出狱后，向国家提出申请赔偿近437万元，包括追究相关责任人的责任，消除影响、恢复名誉等七项要求。然而，按照当时的法律规定，佘祥林最终获赔70万元，剩余385万元精神赔偿要求，因相关法律没有明确规定，而没有得到赔偿义务机关的支持。
这笔赔偿款虽然数额不小，但对于佘祥林失去的11年自由和家庭的破碎来说，只是杯水车薪。佘祥林用这笔钱在湖北宜昌买了一套房子，接回了女儿，希望以此来弥补自己对女儿的亏欠。
2014年，佘祥林的女儿出嫁，这是他唯一的心愿。看到女儿找到了自己的幸福，佘祥林感到无比欣慰。他说，自己这一生经历了太多磨难，现在只希望能够平静地度过余生。
佘祥林案引起了社会各界的广泛关注和深刻反思。这起案件成为推动中国司法改革的重要契机，促使司法机关更加重视证据的收集和审查，强化了"疑罪从无"的原则，推动了中国刑事司法制度的进步。
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