9月9日早上7点30分，警方正式宣布安妮失踪，并展开了大规模的调查行动。由于安妮是耶鲁大学的博士生，而且距离她的婚礼只有几天时间，这起失踪案引起了媒体的高度关注。美国各大新闻头条都在报道这位才华横溢的女博士失踪的消息，来自耶鲁大学的候选人，安妮的失踪引起了全国的关注。
调查行动规模空前。纽黑文市、康涅狄格州以及美国联邦调查局总计出动了超过100名调查人员参与搜寻。耶鲁大学也悬赏1万美元，征集与安妮失踪有关的任何信息。数十名媒体记者驻扎在实验室大楼附近，希望能够第一时间报道警方的任何新发现。
调查人员面临的第一个难题是：安妮究竟在哪里？监控录像显示她进入了实验楼，但没有离开的记录。这意味着她很可能还在楼内，或者是在楼内遇害后被转移了。为了找到安妮，警方采取了多种措施：
首先，他们调取了实验楼及周边区域约700小时的监控录像，安排专人24小时不间断地查看。他们试图从海量的视频中找到安妮的踪迹，或者发现任何可疑人员。
其次，警方对实验楼进行了地毯式搜索。他们拿出建筑蓝图，试图找到所有可能的隐蔽地点，包括天花板、墙壁夹层、地下室等任何可能藏人的地方。调查人员甚至检查了大楼的每一个房间、每一个角落，包括储藏室、卫生间、通风管道等。
第三，警方询问了约150人，包括安妮的同学、同事、导师、室友等，试图了解安妮失踪前后的情况，以及是否有人对她有敌意。
然而，经过几天的搜索，调查人员仍然没有找到安妮的任何踪迹。她就像人间蒸发了一样，消失得无影无踪。
四、血腥线索的发现
随着时间的推移，警方开始意识到，安妮很可能已经遭遇了不测。9月11日，也就是安妮失踪的第三天，调查取得了突破性进展。
调查人员在G13实验室的书架上发现了一滴血迹。这滴血很小，不仔细看很难发现，但在特殊的血液检测剂下，它显得格外醒目。紧接着，调查人员又在G22实验室的储藏室地上发现了一些小珠子。经安妮的室友确认，这些珠子正是安妮失踪当天所戴项链的一部分。
这些发现让调查人员意识到，安妮很可能已经遇害了。G13和G22实验室成为了重点调查区域。调查人员对这两个实验室进行了更加细致的搜查，使用血液检测剂对每个角落进行检测。
在G13实验室的天花板上，调查人员发现了被人动过的痕迹。当他们打开天花板时，一只白色的袜子和一只蓝色的橡胶手套从上面掉了下来。这些物品上都有血迹，经安妮的家人鉴定，这些物品确实属于安妮。
更令人不安的是，调查人员在G22实验室的门上发现了喷射状的血迹。这种血迹形态表明，有人在这里遭受了严重的伤害，血液呈喷射状溅到了门上。在实验室的垃圾桶里，调查人员还发现了染血的实验服和靴子。
种种迹象表明，安妮很可能在G22实验室遭遇了不测。警方开始将注意力集中在这个实验室，试图找到更多的线索。他们仔细检查了实验室的每一寸地面、每一面墙壁、每一个角落，希望能够找到安妮的尸体。
然而，尽管进行了如此细致的搜查，调查人员仍然没有找到安妮的尸体。这让他们感到困惑：如果安妮真的在这里遇害，她的尸体在哪里？凶手是如何处理尸体的？
就在调查陷入僵局的时候，一个意外的发现改变了整个案件的走向。
五、墙中的恐怖发现
9月13日，这原本应该是安妮和乔纳森举行婚礼的日子。然而，这一天却成了安妮家人和朋友们最痛苦的日子。
当天下午，调查人员在实验楼地下室G22附近的一个卫生间里闻到了一股异常的臭味。这种臭味不同于普通的卫生间异味，而是一种令人作呕的腐烂气味。
调查人员立即意识到，这股异味可能与安妮有关。他们在卫生间里仔细搜索，但没有找到异味的来源。于是，他们决定召唤尸体搜寻犬来协助调查。
下午5点左右，尸体搜寻犬在卫生间的一面墙壁前停了下来，开始狂吠。这面墙看起来很普通，上面覆盖着维修电路的金属面板。但在搜寻犬的指引下，调查人员决定打开这面墙。
当金属面板被移开时，一幅令人震惊的画面出现在众人面前：安妮的尸体被倒吊在狭小的电缆间缝隙内。这个空间非常小，只有电脑屏幕那么大，是用来布置电缆线的公用设施通道。
安妮的尸体已经开始腐烂，手脚都有了腐烂的迹象。她的衣服凌乱不堪，内裤滑落到膝盖位置，白色中筒袜只剩下一只。她的脑袋、锁骨、脖颈处都有明显的伤痕，现场惨不忍睹。
经法医鉴定，安妮死于颈部受扼导致的窒息。她的下颌和锁骨骨折，后背有淤伤，这些都是在挣扎过程中造成的。更令人愤怒的是，法医在安妮的内裤和身体上发现了男性体液，表明她在死前曾遭受过性侵犯。
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