处理完伤员，更大的威胁接踵而至——尸体处理和防疫。
时值秋末，天气尚未十分寒冷，若大量尸体得不到及时妥善处理，极易引发瘟疫。
吴铭立刻找到正在指挥清点工作的周知府和王通判，神色严峻地提出建议：“府尊大人，王大人，阵亡者及遇害百姓的遗体必须立刻集中焚烧或深埋！且掩埋地点必须远离水源！否则一旦引发瘟疫，全城军民都将面临灭顶之灾！”
周知府闻言脸色一变。焚烧尸体在当时并非首选，深埋又需要大量人力。
“吴知事，是否过于危言耸听？按惯例，通知家属认领……”
“来不及了！府尊大人！”吴铭急道，“鞑子不知是否去而复返，且许多遗体已开始腐败！瘟疫一起，传播极快，到时悔之晚矣！非常之时，当行非常之法！下官愿亲自督办此事！”
周知府看着城外横七竖八的遗体，又看看吴铭焦急而坚定的面孔，想起他之前处理伤员的“奇法”，终于咬牙下定了决心：“好！便依你！王通判，调一队民夫，再派一队兵卒，听从吴知事调遣，务必尽快处理完毕！要快！”
“下官领命！”
吴铭再次投入到紧张的工作中。他指挥民夫和兵卒，将能找到的遗体全部集中到几个指定地点，泼上火油，进行焚烧。火光冲天，黑烟滚滚，空气中弥漫着难以言喻的气味。无人认领或无法辨认的遗体，则选择远离河流的高地，挖深坑集体掩埋，并撒上石灰（幸好府库中有储备）。
同时，他下令所有参与处理尸体的人员，事后必须用烧开的水彻底清洗身体和衣物，接触过尸体的工具也要用火烤或沸水煮烫。
他还组织人在难民临时安置点和城内水井周围撒上石灰，并反复告诫百姓务必饮用烧开的水，不要吃腐坏的食物。
一连几天，吴铭都奔波在城外和难民安置点，监督各项防疫措施的落实。他嗓子喊哑了，眼圈熬黑了，官袍上沾满了泥污和血渍，整个人憔悴不堪。
然而，他的努力没有白费。
尽管战后景象惨烈，伤亡惨重，但大同城内外，并没有出现大规模瘟疫的迹象。伤员们的恢复情况，也远比以往类似情况要好。
周知府看着渐渐稳定下来的局面，以及虽然疲惫但眼神依旧清亮的吴铭，心中感慨万千。
这位年轻的贬官，不仅有点石成金的经济之才，在这等惨烈的突发事件面前，竟也能如此沉着果断，拿出这些闻所未闻却又行之有效的“奇法”，保全了更多人的性命。
“吴知事，”周知府在一次简短的汇报后，难得地用温和的语气说道，“此次善后，你居功至伟。辛苦了。”
吴铭躬身还礼：“此乃下官分内之事。”
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