邓禹从汾阴渡过黄河，进入夏阳。更始帝的左辅都尉公乘歙率领十万人，和左冯翊的军队一起在衙县抵抗邓禹，结果被邓禹打得大败而逃。
汉朝宗室刘茂在京县、密县之间聚集人马，自称厌新将军，攻下颍川、汝南等地，手下发展到十多万人。刘秀派骠骑大将军景丹、建威大将军耿弇、强弩将军陈俊去攻打他。刘茂最后投降，被刘秀封为中山王。
己亥日，刘秀来到怀县，派耿弇、陈俊率军驻守五社津，防备荥阳以东的敌军；又让吴汉率领建义大将军朱祜等十一位将军，把朱鲔包围在洛阳。八月，刘秀前往河阳。
李松从槀县带兵返回，和更始帝、赵萌一起在长安攻打王匡、张卬。双方打了一个多月，王匡等人战败逃走，更始帝只好搬到长信宫居住。赤眉军开到高陵时，王匡、张卬等人出城投降，然后联合起来进攻长安东都门。李松出城迎战，被赤眉军活捉。李松的弟弟李况是城门校尉，他打开城门，放赤眉军进城。九月，赤眉军进入长安，更始帝只能单人匹马从厨城门逃跑。
式侯刘恭因为赤眉军立了自己的弟弟刘盆子当皇帝，就把自己关进了诏狱。听说更始帝逃跑后，他才出狱，去见定陶王刘祉。刘祉帮他解开刑具，两人一起在渭河边找到了更始帝。右辅都尉严本担心更始帝被赤眉军抓到会连累自己，就带着更始帝到了高陵，说是派兵保护他，实际上是把他软禁起来。更始帝的将相们纷纷向赤眉军投降，只有丞相曹竟宁死不屈，手持宝剑战斗到死。
辛未日，刘秀下诏书封更始帝为淮阳王，还下令：官吏和百姓谁敢伤害他，就按大逆之罪论处；要是把他送到官府，就封为列侯。
从前，宛县有个叫卓茂的人，为人宽厚仁慈，恭敬友爱，淡泊名利，喜欢追求高尚的道德和学问。他为人朴实，不做表面功夫，行事有自己的原则。从年轻时到年老，他从没和人起过争执。乡里的老朋友，即使品行才能和他不一样，也都非常敬爱他。汉哀帝、汉平帝年间，卓茂担任密县县令，他把百姓当作自己的孩子，提拔善良的人，教化百姓，从来不说伤人的话。官吏和百姓都很爱戴他，不忍心欺骗他。
有一次，有个百姓说当地亭长收了他送的米和肉。卓茂问：“亭长是向你索要的，还是你有事请他帮忙才送的，又或者是平时出于感激自愿送的？”百姓说：“是我自己去送的。”卓茂又问：“你自愿送他，他也接受了，那你为什么还要说呢？”百姓回答：“我听说贤明的君主，能让百姓不怕官吏，官吏也不向百姓索取财物。现在我怕官吏，所以才送东西；官吏既然最终收了，我就来向您报告。”
卓茂说：“你真是个不懂道理的百姓！人之所以能聚在一起生活而不混乱，和禽兽不一样，就是因为人有仁爱礼义，懂得互相尊重。你自己不想修养品德，难道还能飞到天上、跑到远方，不在人间生活吗？官吏只是不应该凭借权势强行索取东西。这个亭长向来是个好官吏，你在过年过节时送他东西，这是合乎礼节的。”百姓又问：“如果是这样，法律为什么要禁止呢？”卓茂笑着说：“法律制定的是大原则，而礼是顺应人情的。现在我用礼来教导你，你一定不会有怨言；但如果用法律来治你的罪，你连手脚都不知道该往哪儿放了！在一个家庭里，小错可以批评教育，大错甚至可以杀头。你回去好好想想吧。”
卓茂刚到密县时，对一些政务的处理方式，官吏和百姓都嘲笑他，邻城的人听说后也都讥笑他没本事。河南郡为此还给他派了个代理县令。但卓茂并不在意，依然像往常一样处理政务。几年后，他推行的教化取得了显着成效，密县路不拾遗。后来他升任京部丞，密县的男女老少都哭着送他。王莽摄政时，卓茂因病辞官回家。刘秀即位后，第一时间派人寻访卓茂，那时卓茂已经七十多岁了。甲申日，刘秀下诏书说：“声名天下第一的人，应当接受天下最重的奖赏。现在任命卓茂为太傅，封为褒德侯。”
司马光评论说：孔子说“推举善良的人并教育百姓，能力不足的人就会受到勉励”，所以舜推举皋陶，汤推举伊尹，那些不仁的人就远离了，这是因为有德行的人起了作用。刘秀刚即位的时候，各路英雄豪杰相互竞争，天下局势动荡不安，那些能冲锋陷阵的勇士、足智多谋善辩的人正被世人看重。但刘秀却偏偏能选拔忠厚的大臣，表彰奉公守法的官吏，把他们从平民百姓中提拔出来，安排在公卿大臣的重要位置上。他能够光复汉朝，国运长久，大概就是因为他知道什么是最重要的事情，找到了治国的根本。
刘秀的将领们围攻洛阳好几个月，朱鲔坚守城池，始终攻不下来。刘秀因为廷尉岑彭曾是朱鲔的校尉，就派他去劝降朱鲔。岑彭站在城下，朱鲔站在城上，岑彭向他分析成败形势。朱鲔说：“大司徒刘演被害时，我参与了谋划，后来又劝更始帝不要派刘秀北伐，我知道自己罪大恶极，不敢投降！”
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