国子监“格致堂”开堂授课的日子，选在了一个秋高气爽的清晨。阳光透过新糊的高丽纸窗棂，在光洁的水磨青砖地上投下明亮的格子。空气中没有旧日学堂的墨香与檀香，取而代之的是一种混合着新鲜石灰、桐油和隐约药草气息的奇特味道。
堂内陈设迥异于任何经义讲舍。没有高悬的孔圣像，没有堆叠如山的经史子集。正前方是一块巨大的、涂着黑漆的木板（黑板），旁边放着几支特制的白垩笔。两侧墙壁，则悬挂着几幅巨大的挂图——一幅是线条精准、标注详尽的《新编人体脏腑血脉全图》，其心脏剖面、肠管盘绕之清晰，足以让任何初看者头皮发麻；另一幅则是王徵手绘的《杠杆滑轮省力图示》，简洁的几何线条勾勒出力与距离的关系，冰冷而理性。最引人注目的，是堂中央一张特制的宽大条案上，覆盖着深色绒布，上面静静安放着三台造型奇特的黄铜镜筒——显微定真镜。
第一批通过遴选、获得“格物生”身份的五十名少年，穿着统一的深蓝色棉布袍服，局促而好奇地坐在崭新的杉木长凳上。他们年龄在十二到十五岁之间，成分混杂：有面目清秀、眼神却带着迷茫的良家子（多是中下层官吏或军户子弟，为前途搏一把），也有双手粗糙、指缝残留着墨渍或铁屑的工匠学徒，甚至还有两个眼神机灵、据说是户部夏尚书特批的、精通珠算的商贾之子。此刻，他们或正襟危坐，或偷偷打量四周，或忍不住瞥向那神秘的黑板和铜镜，空气里弥漫着一种混杂着兴奋、忐忑与未知的奇异氛围。
翰林院掌院学士陈文泰和国子监祭酒周鸿儒，作为“督导”，被朱棣强行按在了讲堂侧后方特设的“旁听席”上。两人穿着正式的绯色官袍，与整个格物堂的氛围格格不入。陈文泰面沉似水，花白的胡须微微抖动，目光死死盯着那幅《脏腑全图》，仿佛那是什么亵渎神灵的邪物。周鸿儒则低着头，手指无意识地捻着袍袖边缘，脸色比身上的官服还要黯淡几分。
开堂第一课，主讲者并非李时珍或王徵，而是吴有田。这位曾经的太医院药童，因输血救人和显微镜下的敏锐观察，已被破格擢升为格物院“格致学正”，专门负责基础教学。
吴有田深吸一口气，努力压下心中的激动和一丝面对大儒的紧张。他走到黑板前，拿起一支白垩笔，写下三个方正的大字：“格物之眼”。
“诸位格物生，”吴有田的声音带着年轻人特有的清朗，努力让每个字都清晰可闻，“今日起，尔等踏入此门，所学所观，非圣贤微言，非道德文章，乃是天地万物运行之‘实’理！欲窥此理，首重一物——此镜！”他回身，郑重地指向条案上的显微定真镜。
所有人的目光瞬间聚焦在那黄铜镜筒上。
“此镜，名曰‘显微定真’！顾名思义，能显微末，定见真实！”吴有田拿起一片早已准备好的、干净的载玻片，又从一个琉璃小瓶中，用银质小镊子夹取了一滴水。“此水，取自格物院莲池，看似清澈无物。然…”
他动作麻利地将水滴在载玻片上，覆上薄薄的盖玻片，小心翼翼地将其置于一台显微镜的载物台上。调整反光铜镜，光线聚焦。然后，他示意前排一个看起来胆子颇大的工匠学徒上前。
“你，凑近目镜，观之。”
那学徒有些紧张地咽了口唾沫，在众人注视下，将眼睛凑近了小小的目镜孔。
“啊——！” 一声短促而惊骇的尖叫猛地从那学徒口中迸发！他如同被火燎到般猛地向后弹开，脸色煞白，指着显微镜，嘴唇哆嗦着，却一个字也说不出来，只剩下满眼的难以置信和恐惧。
这反应瞬间引爆了堂内所有人的好奇心！连后排那几个原本蔫头耷脑的良家子也伸长了脖子。旁听席上的陈文泰眉头紧锁，周鸿儒则抬起头，眼中闪过一丝惊疑。
“看…看到什么了？”旁边的同伴忍不住问。
“虫…虫子！活的！好多…好多小虫子！在…在水里游！”那学徒终于找回声音，语无伦次，带着强烈的后怕。
“活的？！”众人哗然！清澈见底的池水里有活虫？！这颠覆了所有人的认知！
“肃静！”吴有田提高了声音，压下骚动。他眼中闪烁着一种近乎布道的光芒，“不错！是活物！此物非妖非邪，乃天地间无处不在之‘微虫’！肉眼不可见，非其不存在！此镜，便是洞开此不可见世界之窗！”
他再次示意下一个格物生上前观看。这一次，是一个脸色发白的良家子。他战战兢兢地凑近目镜，片刻之后，同样发出一声压抑的惊呼，身体僵直，脸上的血色褪得干干净净，只剩下纯粹的、认知被颠覆的震撼。
一个接一个。每一次观看，都伴随着瞬间的僵硬、倒吸冷气、或压抑的惊呼。堂内的气氛变得极其诡异。那些亲眼目睹了微观世界“生机勃勃”的少年们，脸上最初的恐惧渐渐被一种巨大的茫然和困惑取代。他们从小被教导“水至清则无鱼”，教导“天人感应”、“气化万物”，何曾想过，一滴看似纯净的水，竟是万千微小生命的猎场？！
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