后来，刘秀就下诏书召彭宠进京，彭宠上奏说希望能和朱浮一起被召见，但是刘秀没同意，彭宠心里就更犯嘀咕了。他老婆性格强势，受不了被人这么欺负，就劝他别去，还说：“如今天下还没平定，到处都有人称王称霸。咱们渔阳是大郡，又拥有精良的兵马，干嘛要因为别人的诬告就离开这儿！”彭宠又找来亲信商量，大家都很讨厌朱浮，却没人劝他进京。看到他迟迟不动身，刘秀就派彭宠的侄子子后兰卿去劝他，结果彭宠就把侄子给扣下了，直接起兵造反了。随后，他就任命了将领，还亲自带着两万多人去蓟地攻打朱浮。而彭宠觉得自己和耿况都立过大功，却都没得到多少赏赐，就多次派人去拉拢耿况，可耿况根本不搭理他，还把他派去的使者给杀了。
就在彭宠起兵的时候，延岑又造反了，他直接派兵把南郑包围了起来。然后就去攻打汉中王刘嘉，很快延岑就占领了汉中，接着又向武都进军，结果被更始帝的柱功侯李宝给打败了，最后逃到了天水。公孙述又派将领侯丹拿下了南郑。而刘嘉则开始收拢那些逃散的士兵，很快就聚集了几万人，他又让李宝当丞相，然后从武都出兵向南去攻打侯丹，但是没打下来，就退到了河池、下辨，在这里又和延岑打了一仗，延岑没打过，就向北撤退，一直进了散关，最后到了陈仓，刘嘉追上去又把他打败了。这时，公孙述又派将军任满从阆中出兵前往江州，向东又占据了扞关，这下公孙述就完全控制住益州地区了。
三月，刘秀宣布大赦天下。
那时候，更始帝手下还有不少大将在南方，不肯向刘秀投降。有一回，刘秀把将领们召集起来商量军事，一边用檄文敲着地一边问：“郾城的敌军实力最强，然后就是宛城，谁愿意去攻打？”贾复马上站出来说：“我请求去攻打郾城！”刘秀就笑着说：“有执金吾贾复去攻打郾城，我还担心啥呢！大司马就去攻打宛城吧。”于是刘秀就派贾复去攻打郾城，很快就把郾城攻破了，守将尹尊投降。贾复又向东进军，攻打更始帝的淮阳太守暴汜，暴汜也投降了。
这年四月，虎牙大将军盖延带着驸马都尉马武等四位将军去攻打刘永，结果把刘永打得落花流水，然后把他围困在了睢阳。就在这时，原来更始帝的将领苏茂造反了，他杀了淮阳太守潘蹇，又占据了广乐，随后就向刘永称臣。刘永封苏茂为大司马、淮阳王。
吴汉率军去攻打宛城，宛王刘赐则带着更始帝的老婆孩子跑到洛阳向刘秀投降，刘秀就封刘赐为慎侯。这时，刘秀的叔父刘良、族父刘歙、族兄刘祉也都从长安赶来投奔。甲午那天，刘秀就封刘良为广阳王，刘祉为城阳王；还封了自己哥哥刘演的儿子刘章为太原王，刘兴为鲁王；更始帝的三个儿子刘求、刘歆、刘鲤也都被封为列侯。
就在刘秀把自家儿子侄子封了王之后，邓王王常也来投降了，刘秀见了别提有多高兴了，还说：“我见到王廷尉，南方就不用担心啦！”随后就任命王常为左曹，封他为山桑侯。
五月，刘秀又封族父刘歙为泗水王。
刘秀觉得阴贵人性格宽厚仁慈，就想立她当皇后。但阴贵人考虑到郭贵人已经有了儿子，说啥都不肯接受。到了六月，刘秀只好立郭贵人为皇后，立郭贵人的儿子刘强为皇太子，还下令大赦天下。
到了丙午日，刘秀又封泗水王刘歙的儿子刘终为淄川王。
秋天的时候，贾复就向南进军，前去攻打召陵、新息，很快就把这两个地方打下来了。后来，贾复手下的一个将领在颍川杀了人，颍川太守寇恂就把这人抓起来关进了监狱。当时国家刚刚建立，军队里犯法的人大多都被从轻处理，可寇恂却直接把这人拉到集市上砍了头。可贾复觉得这事儿太丢脸了，等他回军路过颍川的时候，就对手下说：“我和寇恂都是朝廷大将，他却故意让我难堪，今天要是见到他，我非得亲手宰了他不可！”
寇恂听说了贾复的打算，就不想和他碰面。寇恂的侄子谷崇却说：“我是武将，可以带剑在您身边保护您，要是贾复敢动手，我能对付他。”寇恂却说：“不行，当年蔺相如连秦王都不怕，却对廉颇一再忍让，那是为了国家大局。”于是，寇恂就让颍川下属各县准备了丰盛的酒菜，贾复的军队要是进入颍川境内，那么每个士兵就能得到双份食物。寇恂出城去迎接贾复，可是刚见了面就借口生病回去了。贾复本想带兵去追寇恂，可手下将士们吃好喝好都喝醉了，就只能作罢。
随后，寇恂就派谷崇把这件事报告给刘秀，刘秀马上就召见寇恂。等寇恂到了之后，就去见刘秀，当时贾复也在。贾复一看寇恂来了，就想起身躲开。可是刘秀却说：“现在天下还没有完全平定，你们俩可不能像两只老虎一样私下争斗！今天我来给你们调解。”在刘秀的调和下，两人并排而坐，聊得特别开心，最后还同坐一辆车出宫，成了好朋友才分开。
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