这番安排，将扶桑都护府打造成了一个权力相互制约的机构。多尔衮拥有军事指挥权和最高名义，但行政、财政、人事、监察、情报等关键权力被分散并直接对中央负责，如同给他套上了无形的却坚实的锁链。
名护屋城都护府大堂，多尔衮端坐在都护主位之上，接受属官拜贺。他手持麟符，身着御赐蟒袍，威严无比。但当他看到下手分坐的陈子壮、耿精忠，以及那一排目光精明、举止有度的流官时，心中并无多少喜悦，反而升起一股沉重的压力。
他明白，崇祯皇帝给予了他荣耀和权力，但也给他设置了重重藩篱。他不再是那个在虾夷地和九州战场上可以独断专行的镇东将军了。如今，他每项命令，都需要考虑文官系统的配合，财政需要陈子壮的副署，与本土的联系受耿精忠的制约，甚至手下多了许多直接向北京汇报的“眼睛”。
“范先生，” 晚间，他在密室中对范文程叹道，“陛下此举…… 是信不过我啊。”
范文程低声道：“王爷， 此乃帝王常态。陛下既要用王爷 之能， 又要防王爷之势。如今局面， 看似束缚， 实为 保全。 王爷只需 谨守臣节， 办好差事， 将这扶桑之地， 治理得井井有条， 陛下自然安心， 王爷亦可永享富贵。”
多尔衮默然良久。他知道，自己已彻底被绑上了大明的战车，未来的命运，与这个扶桑都护府以及北京紫禁城里的那位皇帝，紧密相连。他必须在这权力的枷锁下，舞好这根沉重的权杖。
大明扶桑都护府的建立，标志着明朝对日战争的军事征服阶段基本结束，进入了更为复杂的统治消化阶段。九州岛上，明朝的屯田兵开始圈占土地，矿监深入山区勘察，市舶司的官吏在长崎清点货物、制定税则。
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