九尾事件
在鸣人出生当天，水门喜极而泣，但就在此时戴着面具的神秘男子突然现身并挟持了鸣人。面具男的目的是控制玖辛奈体内的九尾袭击木叶，虽然水门救下了鸣人，但却没能阻止面具男召唤九尾，于是水门在安置好鸣人和玖辛奈之后便前去迎战面具男，在交战过程中惊讶于面具男的能力，怀疑他可能是当年与初代火影交战过的宇智波斑。水门认为面具男是个危险的人物，在经过几个回合的交手后以飞雷神第二段打败面具男，面具男受伤逃走。此时九尾已开始袭击木叶，水门以飞雷神之术将自己和九尾带离木叶村，将九尾的阴属性查克拉以尸鬼封尽和自己一同封印，阳属性查克拉则以八卦封印封印到刚出生的鸣人体内。在对鸣人留下最后的话语后，水门和玖辛奈便双双去世。
水门之死
修复封印
佩恩之战的时候，鸣人即将撕下封印，四代火影出现在鸣人的意识空间，鸣人向四代诉说这些年的辛酸，而四代只能对鸣人怀着歉意：“想以父亲的身份道歉也不够资格吧。”此后，四代火影将其让鸣人成为九尾人柱力的原因以及十六年前面具男的真相告诉了鸣人，并解除了鸣人心中的疑惑，修补封印后，因查克拉用尽而消失。
忍界大战
在第四次忍界大战期间，佐助为了知晓一切的真相而令大蛇丸复活，并要求大蛇丸带他见“知晓一切的人”。大蛇丸利用“尸鬼封尽·解”使四位火影以秽土转生的方式复活，佐助自初代火影那里得到了他想要的答案，和四位火影一同奔赴战场。
在最后的战场，水门终于与儿子鸣人再会，并且发现了面具男就是带土的事实。带土在那之后便成为十尾人柱力，水门面对这样的带土而陷入苦战，右手还因为带土的求道玉和阴阳遁无法修复，便和鸣人联手与带土对抗。之后鸣人在尾兽拔河中胜了带土，带土因而失去六道仙人的力量。卡卡西打算亲手了结带土，水门见状上前加以制止，并指出卡卡西没有及时从内心深处救赎带土的错误。而带土随即遭到黑绝附身，与水门、卡卡西对峙；此时我爱罗和小樱将因九尾被抽离而濒死的鸣人送到水门之处，水门为了拯救鸣人的性命打算将自身的九尾阴查克拉传输给鸣人，却遭到黑绝的阻挠，九尾也被黑绝，也就是被附身的带土夺取。随后赶到的斑打算劝诱带土重返自己一方，水门为阻止斑而进入仙人模式发动攻击，但却反而被斑切断左臂。失去双臂的水门难以再战，不过仍然在一旁支援卡卡西以及随后赶来的凯的战斗，并在阿凯以八门遁甲之阵与斑进行殊死搏斗之时与在场众人制定战术进行援护，更以飞雷神之术舍身替阿凯转移斑的阴阳遁术攻击，以使阿凯的攻击奏效。
当斑施展无限月读之际，水门因飞雷神之术的缘故转移到木叶火影颜岩上面，对突然发生的异变感到惊异；同时感觉到由于辉夜复活而产生的庞大查克拉，与其他三位火影一同赶往鸣人所在的地方。在那里，柱间由于触碰到残留在当地的斑的下半身而使六道仙人现身，六道仙人集合水门与其他三位火影以及历代各影的力量将成功封印辉夜的鸣人等第七班成员召唤回原先的世界。随后六道仙人解开秽土转生之术，水门在离开之前向鸣人祝贺“生日快乐”，鸣人也向水门说出了之前没能说出的各种话语，并希望水门能将这些话语转达给母亲。水门说“我一定会转达给她的”，之后因秽土转生解除而消失。
角色能力
忍术技能
飞雷神之术
S级，由第二代火影开发的空间忍术，利用术式达到瞬间移动，施术者会事先在目标上留下飞雷神术式，即可使施术者或与施术者查克拉间接接触的物体进行瞬间移动。
施术者能够在精力充沛时多次转移庞大目标。
此术可用于进攻、缩短远程忍术距离、扰乱、突袭对手以及转移目标，也可以用于危急时回避、逃跑。发动时不需要结印。
飞雷神二段
A级，由第二代火影开发，将飞雷神之术与苦无相结合，在战斗中投出已贴有飞雷神术式的苦无，用于分散敌人的注意力，当苦无飞到对方背后时，施术者瞬间移动到敌人的上空手持苦无从上至下斩杀敌人，可以闪避敌人的攻击。
水门在飞雷神二段的基础上增加了螺旋丸的应用。以此将第二代火影原本搭配苦无从上至下斩杀敌人的作战方式改为搭配螺旋丸从上至下重创对手。
飞雷神导雷
使用飞雷神将尾兽玉转移至另一个地点，二代火影和四代火影可以一人转走一颗。
仙术
仙人模式
吸取自然之力后自身所呈现的模式，可使查克拉量大增，所发动的忍术威力也会极大地增强，在漫画665话中，四代第一次使用了仙人模式，外形改变与鸣人相同，但是水门是由自来也教导自学的，所以不怎么常用
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