中山先生亲自挂帅，出师北伐。派黄兴为北伐陆军参谋长，并制定了雄心勃勃的六路北伐计划：
以湘鄂为第一军，沿京汉路北进。
宁皖为第二军，向河南进攻。
淮杨为第三军，出华东而取淮海。
烟台为第四军进攻山东。
合关外之军为第五军，
山陕为第六路，向北京进攻。
一、二、三、四军到达指定地点后，即与五、六路军汇合，最后攻破北京。
南京临时政.府成立之初，所面临的客观形势和拥有的军事实力都具有一定优势。集中在江苏境内准备北伐的各省军队达17个镇，汇集在湖北的各省援鄂之师也接近10万人，加上留驻独立各省的军队，革命军队的官兵总数不下三、四十万人。
再加上清廷所有的海军大小战舰四十余艘已反正，皆可支援陆路北伐。虽然其中多是新募之卒，未受过军事训练，但多由革命党人统率，士气旺盛。
最出色的当属蓝天蔚率领的北伐军在山东和东北的战绩。
一九一二年一月十二日，孙中山从南京给正在上海准备出师北伐的蓝天蔚去电：“北伐之沪军即海容、海琛、南琛三舰概由贵督节制，以一事权。”
一月十六日蓝天蔚率领主要由参加上海起义的敢死队员以及青年学生组成的北伐民军数千人，并刘基炎统领的沪军、许崇智统领的闽军、李燮和统领的光复军一道，分乘海容、海琛和南琛三艘军舰以及泰顺、新昌、公平等运输船由沪北上。
他率领将士们斗志昂扬，齐声高唱从湖北传过来的军歌破浪前进！北伐军首先攻克烟台，与山东、关外民军会师。声势大振，直窥京津，把革命的烽火烧到了清王朝的大门前。
蓝天蔚在烟台设立了北伐军根据地，并立即命令部队星夜兼程，分兵袭取了山东境内的登州、黄县，打通北伐门户。
他在烟台庄.严宣布：北伐军不日将开赴东三省攻略各地，东北将“克日光复”。
为了给北伐军登陆作战创造有利的条件，蓝天蔚亲自乘船到大连，将当地分散的革命力量统一组织起来，并布置了各自分担的任务。在军事上，蓝天蔚派海容等舰只轮番在营口等处海面游弋，进行示威，牵制清军兵力。
他还向日本关东都督发出照会：“切望贵国确保南满铁路之中立，对民军及清军，均应一律同等对待”，以便减轻民军的军事压力。
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