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教皇逃走了，主教逃走了，教廷的组织机构被瘟疫抹掉了，昔日门庭若市、车水马龙的教皇宫，居然犹如废墟般变得一片死寂，到处弥漫着腐败的臭气。但即使是在这样的死亡之城中，依然有许许多多平凡的英雄。她们的无私行为，让那些对人性抱着悲观看法的人，也能看到若隐若现的光明。
当大批病人被亲人遗弃的时候，阿维尼翁城内的修女却勇敢地敞开大门。接纳了患黑死病的穷人。她们不俱死亡，夜以继日地照顾病人。她们为此付出了生命的代价：几乎所有的修女都死去了。
记载她们事迹的人如此写道:“……我们必须相信，她们必定荣升天堂，安息在基督身旁……”
当教皇宫被抛弃的时候，教皇最器重的首席御医乔立克也不顾生命危险，依然留了下来救死扶伤。这位首席御医虎背熊腰，一嘴浓密的胡子，走起路来像头大笨熊。跟人谈话的时候，口中总是弥漫着浓烈的大蒜味儿，仿佛一个粗野的维京海盗。但是一旦拿起外科器械，他就会变成全欧洲手艺最灵巧的人。
乔立克的身世就是一部中世纪的“贫儿翻身记”，他生于法国的一个小村庄，父母都是普通农民。不出意外的话，他也该是个农民，老老实实娶妻生子，种一辈子地。但乔立克有一种罕见的医学天赋。在他很小的时候，就无师自通地学会处理伤口，矫正断骨，在当地小有名气。有一次，有一位贵族夫人从马上摔了下来，跌断了腿。请来的医生都束手无策，它的腿开始腐烂化脓，眼看就要保不住了。这个时候，有人把乔立克领来了。这个不识字的农家孩子给她处理了伤口。十天以后，这个女士就已经可以去做礼拜了。
这次治疗使乔立克的命运产生了转机。一位贵族听说了这件事之后深受感动。他答应出一笔钱，让这个农村孩子接受最好的医学教育。从此，乔立克离开了乡村，走向了外面的广阔天地。
后来，这个农家孩子成了欧洲最优秀的医生。他先后担任过蒙彼利埃大学和巴黎大学的教授。由于命运的再次垂青，他应教廷的邀请，前往阿维尼翁，担任教皇陛下的首席御医。
大家通常以为教会都是坚决反对解剖尸体的，但并非总是如此。克雷芒六世教皇就是解剖学的支持者，他甚至公开鼓励乔立克解剖尸体，‘“以便能发现疾病的根源”。所以乔立克很喜欢阿维尼翁，他在这里一待就是二十多年，写了一部《外科医学大全》。以后的三百年里，这本书一直被奉为医学圣典。
所以，为了报答教皇的信任与栽培，乔立克不顾生命危险选择了留守教皇宫，想尽各种办法治病救人，他并不清楚这场瘟疫到底是什么病，他也不清楚自己到底能不能帮助病人，但他还是想要做点儿什么。
当然，乔立克也知道这个病传染性很强，必须采取防护措施。所以他穿上了遮盖全身的黑色长袍，戴上了厚布手套，脑袋上顶着黑礼帽。最后还戴上了一个鸟嘴形状的奇怪面具，那个鸟嘴其实是个过滤器，用于避免通过鼻孔和嘴感染瘟疫，鸟嘴的中间塞了海绵，海绵里面吸满了混着肉桂粉的醋。
如此装扮之后，乔立克看上去就像一只诡异的大乌鸦。这只大乌鸦在逐渐走向死亡的阿维尼翁城内不断地穿梭，想尽了各种匪夷所思的办法来治病放血、灌肠、烟熏、服用矿石粉末、涂抹香料油膏……但最后的结果全部都是失败：这个时代的欧洲医学水平，根本无法对鼠疫进行有效的治疗。
然后，乔立克也病了。这套大乌鸦似的防护服显然没起到效果，他发现自己的腋下也长出了瘤子。
于是，他冷静地回到教皇宫，提起了笔，准备用生命中最后的时间，记录下自己所看到的一切。
这是他作为医生和观察者的身份，能够为这个世界做的最后一件本职工作。
“……整个国家的死亡率高得难以想象。走过这个国家的旅行者说，在田野里、在城镇里、在荒废的大地里，到处是无人照看的牛羊。谷仓和酒窖的大门敞开，许多房屋里空无一人……原来有两万人的城镇，现在只剩下了两千人。原来有一千五百人的小镇，现在只剩下了一百人。大片的土地荒废了……我所见到的，我所听到的，我都记录在了这里。后代恐怕很难相信我所说的这一切……”
“……这些触目惊心的事实让人害怕，但遗憾的是，我们根本看不到某个鼓舞人心的英雄人物或某个惊天动地的壮举，就像老故事中屡见不鲜的例子那样……世界上恐怕没有比一场瘟疫更缺乏戏剧性的东西了，而且越是可怕的大瘟疫，由于时间拖得很久，往往是非常单调的。根据我的亲身经历，瘟疫的可怖日子并不像是滔天烈火，却像是缓缓碾来的石磨，其势所至，一切都被压得粉碎就像某些人在监狱里看到的那样，等死总是让人最绝望的事情，而不知刑期在何时的情况下，更是让人连心理准备都没法做……”
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