某型月平行世界——
圣杯战争并不是世界的主题，却是人类能够从英灵殿中“偷”英灵用用的少数高端的大魔术。
虽然最为粗大的时间轴中，第三次圣杯战争，爱因兹贝伦一定会违规召唤一个Servant，这个职阶被称为Avenger的英灵安哥拉·曼纽会让无色圣杯变成黑圣杯，从而导致之后的圣杯战争打到最后，满门英烈的卫宫家都会设法破坏圣杯，到最后甚至被解体。
但是也有其他小的分支，毕竟爱因兹贝伦也可能召唤其他职阶的违规Servant，比如，要是召唤出Ruler，有着几个特殊GM权限的裁定者，圣杯战争或许会轻松些了。
然而，那些古老的注重传统的魔术世家，对外人的轻视，也足以葬送他们——
这个时间轴的第三次圣杯战争，有个Master很干脆地通告了德国的军方，而了解到魔术和圣杯的作用的德国理所当然地出动了军队。
大圣杯是一个庞大的魔术，怎是人力可以轻易撼动？
但那观点只适用于古代人，就算是魔术师，以筹备圣杯战争的御三家来说，也经不起军队平A，加上协同了某擅长灵魂秘术的魔术师，间桐脏砚也倒下了。
至于庞大的魔术仪式场地怎么办？德军很干脆地出动机械将整个大圣杯和已至于内的小圣杯从地下挖了出来，用多个齐柏林飞艇吊起来，送上几万吨级的军用运输船，给运回了欧洲。
虽然德国很想用圣杯的力量打赢世界大战，但是那个告密的Master又背叛了德国，二战中圣杯再次被夺，从此下落不明。
圣杯战争的资讯被公布，此后在世界各地都发生了圣杯战争的“亚种”，召唤英灵变得稀松平常。然而这些亚种的圣杯战争召唤的英灵数量有限，且仅仅为了获得超常魔力而进行。
事实上，大圣杯被搬运至罗马尼亚，六十年后，该地区势力最大的一支魔术师——尤格多米雷尼亚家族，宣布持有大圣杯，向时钟塔宣战，并打算成立新的魔术协会。
他们利用圣杯系统召唤了七名从者（黑方），而时钟塔利用了大圣杯的“非常时期机制”，另外召唤了另一派别的七名从者（红方）。同时由于这次圣杯战争有些不正常之处，圣杯本身也召唤了一名特殊职阶的从者Ruler。
黑方本来早已布置好了以七名Servant为中心，让人造人和魔偶组成的大军迎击魔术协会的策略，但是一开始就发生了意外——
Saber齐格飞在Rider阿斯托尔福的鼓动下，将自己的心脏送给了一个人造人；Assassin开膛手杰克杀了召唤自己的御主。
齐格飞是个屠龙英雄，因沐浴了龙血得到了不死身，一生以完成他人的诉求度过，最后因有人希望他死，为了实现那个诉求抱憾而亡。他抱着生前无法实现的愿望参加圣杯大战，为的就是以自己的意志实现一个他人的愿望。结果就是实现了一个有着求生欲的人造人的愿望而已。
本次圣杯大战的裁定者，Ruler贞德·达尔克（将奥尔良从百年战争中解放出来的法国英雄，天主教圣人）对此也给予认可。虽然黑方为了补充战力打算以红方有与Ruler为敌为由招揽贞德，但贞德显然是不会答应的。
开膛手杰克与原本应当作为召唤献祭的女子进行了契约，打算杀掉其他所有势力，还因Master没有资质而到处捕杀一般人获取魔力。尤格多米雷尼亚和魔术协会都为此焦头烂额。
黑方在自认为不利的情况下，与魔术协会开战，本来主场作战，加上各方面因素，尤格多米雷尼亚并无劣势，但是战况突然就急转直下了——
红方的Assassin赛米拉米斯，乘坐巨大的空中要塞来到大圣杯上空，将大圣杯盗走了。
虽然黑方也出动人手追上去了，但是——
赛米拉米斯，是古代亚述帝国的女王，世界最古的毒杀者，拥有能兼具Assassin和Caster职阶技能的极稀有技能“双重召唤（DoubleSummon）”，在她以职阶能力作成的阵地内，黑方吃了大亏。
最后，红方以仅仅损失一个Berserker的代价，使得黑方的Berserker弗兰肯斯坦灭了；Rider的御主也死了；黑方的Lancer弗拉德三世及其御主——尤格多米雷尼亚的当家也双双被击破了；黑之Caster叛变，杀了自己的御主，哪怕黑之Caster最后被反杀，也给黑方带来了极大麻烦；损失的人造人和魔偶超过八成。
不过黑方的失败，除了以上外因，还有一个内因——
尤格多米雷尼亚给予Servant的魔力是由大量的人造人电池供给的，而被贞德保了的人造人趁着大战期间，为了解放人造人而把那些人造人“电池”都给拆了。尽管这只是次要原因。
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