三个世界似乎转变了存在形态，由原本的圆球状，被拉长压扁，均匀地附着于宇宙胎膜之外、大罗天之下，将整个盘古宇宙的外层给包了起来。
若是此时有人在宇宙之外的混沌中，观测整个盘古宇宙的结构，就会发现此时的宇宙结构，与太古天皇时代截然不同。
太初时代，混沌初开，天地始分，轻清在上，重浊在下。一片汪洋大海，浮于重浊之上，浩瀚汪洋，环绕于大陆之外。天上地下，天地一体，无分区别。直往上飞，便是化为天穹的鸿蒙清气海；直往下行，便是承托起无边汪洋大海与盘古大陆的鸿蒙浊气。
天皇纪初期，太一辟鸿蒙清气海为太一天界。天心运转，鸿蒙浊气中诞生九幽之地。后，九幽之地辟为冥界，与天界相互呼应。自此，天界与幽冥互相分离，化为另外两个空间，不与大地同处一个空间层面。
此时的盘古宇宙，大体以天界、地界与冥界为中心，演化出各个层次的虚空。除去大周山还与天界、幽冥相连之外，往上往下，再也无法直接前往天界与幽冥世界。整个宇宙处于界壁胎膜包裹于宇宙之外，天界在顶、幽冥在下、地界处于中间，四外皆是无量虚空的形态。
此时的宇宙仿佛一枚鸡子，蛋清部分为无边虚空，中心蛋黄所在便是大地所在的空间，太一天界位于蛋清上半，靠近蛋壳部分，周天星辰尽数汇聚于天界之中，幽冥世界位于蛋清下部，镇压着无边鸿蒙浊气。
天皇时代中期，宇宙再度拓展，天界亦随之延展拓宽，周天星辰除去三百六十五主星之外，其余星辰自天界溢出，分散与无边虚空之中，演化出无边星海。宇宙各个虚空层次中，有诸神开辟自神国世界，填充宇宙演化。自此，宇宙繁荣昌盛，可谓是盛极一时。
至天皇末期，盘古宇宙主体径约十二亿九千六百万光年。若再算上各层虚空所演化的世界，宇宙体量之广，足有一百二十九亿光年之巨。只是天皇一战，三千大罗所辟各自大千神国，皆被毁伤殆尽，只余寥寥数十个勉强存留。
此时的地皇纪，宇宙结构早已与天皇纪时不同：宇宙大略为圆柱形态，鸿蒙浊气与冥界处于宇宙底部。冥界至大水渊面之间，相隔一层无垠虚空，无数虚空层叠罗列，汇聚成无边无际地虚空海。在这虚空海的诸多虚空层叠中，便是无数破碎州陆，神国残片，乃是曾今的神国废墟。大水渊面之上，到天界的这层虚空，也隔着一片极厚的虚空层，这层虚空也是有无数虚空层次组成。只不过与底层的无垠虚空海不同。这层虚空之中，充斥无数星辰碎片与许多天之清气。使得整个宇宙看起来，就如一尊上小下大没有‘细腰’的葫芦。
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