延寿等人率领残余部众依山固守，太宗命令各路军队包围他们，长孙无忌下令拆毁所有桥梁，截断他们的退路。己未日，延寿、惠真率领三万六千八百人请求投降，进入军营大门后，跪地膝行前进，叩拜请罪。太宗对他们说：“东夷的年轻人，在海边逞强作乱，至于决战取胜，当然比不上老年人，从今以后还敢和天子交战吗？”他们都趴在地上无法回答。太宗挑选耨萨以下酋长三千五百人，授予他们武将官职，迁到内地，其余的人都释放，让他们返回平壤；这些人都双手合十，以额头触地，欢呼的声音几十里外都能听到。太宗俘获靺鞨士兵三千三百人，全部活埋。缴获五万匹马，五万头牛，一万领铁甲，其他器械也与此相当。高丽全国上下极为震惊，后黄城、银城的守军都弃城逃跑，几百里内再无人烟。
太宗派人骑快马送信给太子，还写信给高士廉等人说：“我作为将领，做得怎么样？”将所到的山改名为驻跸山。
秋季七月辛未日，太宗将军营迁到安市城东岭。己卯日，下诏标记战死士兵的尸体，等军队返回时一同带回。戊子日，任命高延寿为鸿胪卿，高惠真为司农卿。
张亮的军队经过建安城下，营垒还没加固，士兵大多出去砍柴放牧，高丽军队突然赶到，军中惊慌混乱。张亮一向胆怯，坐在胡床上，直视前方不说话，将士们见他这样，反而认为他勇敢。总管张金树等人击鼓整顿军队进攻高丽，打败了敌军。
八月甲辰日，侦察骑兵俘获莫离支的间谍高竹离，将他反绑着带到军营大门。太宗召见他，解开绳索问道：“你怎么这么瘦？”高竹离回答说：“我秘密小路潜行，已经几天没吃东西了。”太宗下令赐给他食物，说：“你作为间谍，应该尽快回去复命。替我转告莫离支：想要知道军中消息，可以派人直接到我这里来，何必偷偷摸摸辛苦潜行呢！”高竹离光着脚，太宗赐给他草鞋后遣送他回去。
丙午日，太宗将军营迁到安市城南。太宗在辽东境外，凡是设置军营，只派哨兵警戒，不挖掘壕沟修筑营垒，虽然逼近高丽城池，但高丽军队始终不敢出城抢掠，士兵们单独行动、在野外宿营，就像在中原一样安全。
太宗将要讨伐高丽时，薛延陀派使者入朝进贡，太宗对使者说：“告诉你们的可汗：如今我父子东征高丽，你们要是能前来侵犯，就尽快来！”真珠可汗非常惶恐，派使者道歉，还请求出兵协助唐军；太宗没有同意。等到高丽在驻跸山战败，莫离支派靺鞨人劝说真珠可汗，用丰厚的利益引诱他，真珠可汗因畏惧唐朝而不敢行动。九月壬申日，真珠可汗去世，太宗为他举哀。
起初，真珠可汗请求立他的庶长子曳莽为突利失可汗，居住在东方，统领各部族；立嫡子拔灼为肆叶护可汗，居住在西方，统领薛延陀本部；太宗下诏批准，都按照礼节册封。曳莽性情暴躁，轻率用兵，和拔灼不和。真珠可汗去世后，曳莽前来奔丧。安葬完毕后，曳莽担心拔灼谋害自己，先返回自己的部落，拔灼追击并杀死了他，自立为颉利俱利薛沙多弥可汗。
太宗攻克白岩城时，对李世积说：“我听说安市城地势险要、士兵精锐，城主有才能又勇敢，莫离支作乱时，城主据城坚守不服从，莫离支攻打不能攻克，只好与他和解。建安城兵力薄弱、粮食稀少，如果出其不意进攻，一定能攻克。你可以先攻打建安，建安攻克后，安市城就被我们包围了，这就是兵法所说的‘有的城池不必攻打’。”李世积回答说：“建安在南边，安市在北边，我军的粮食都在辽东；如今越过安市去攻打建安，如果敌军截断我们的运粮通道，该怎么办？不如先攻打安市，安市攻克后，就可以大张旗鼓地进攻建安了。”太宗说：“任命你为将领，怎么能不采用你的计策。不要耽误我的大事！”李世积于是攻打安市城。
安市城的人望见太宗的旗帜和车盖，就登上城楼击鼓呐喊，太宗大怒，李世积请求攻克城池那天，将城里的男子全部活埋。安市城的人听说后，更加坚守城池，唐军攻打了很久都没能攻克。高延寿、高惠真向太宗请求说：“我们已经归顺大唐，不敢不献上诚心，希望天子早日成就大功，我们也能和妻子儿女相见。安市城的人顾惜自己的家，人人奋勇作战，不容易迅速攻克。如今我们率领高丽十几万军队，望见唐军旗帜就溃败，全国上下胆战心惊，乌骨城的耨萨年老体衰，不能坚守，调兵逼近那里，早上到达晚上就能攻克。其余沿途的小城，必定望风而逃。然后收缴那里的物资粮食，大张旗鼓前进，平壤一定守不住。”大臣们也说：“张亮的军队在沙城，召见他两天就能赶到，趁着高丽惊恐不安，合力攻克乌骨城，渡过鸭绿江，直取平壤，就在于这次行动了。”太宗准备听从这个建议，只有长孙无忌认为：“天子亲征，和将领们不同，不能冒险侥幸行事。如今建安、新城的敌军还有十万人，如果进军乌骨城，他们都会跟在我们后面，不如先攻破安市，攻取建安，然后长驱直入，这才是万全之策。”太宗于是停止了这个计划。
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