苏定方的军队抵达业叶水，思结部众据守马头川。苏定方挑选一万精兵、三千骑兵疾驰前往袭击，一天一夜行军三百里，黎明时分抵达城下，都曼大惊。双方在城外交战，都曼战败，退守城池。到了傍晚，各路军队相继赶到，于是包围城池，都曼恐惧而出城投降。
显庆五年庚申（公元660年）
春季正月，苏定方在乾阳殿献上俘虏。司法部门请求诛杀都曼，苏定方请求说：“臣答应过不杀他，所以都曼才出城投降，希望陛下赦免他的性命。”皇帝说：“朕违背法律来保全你的信用。”于是赦免了都曼。
甲子日，皇帝从东都出发；二月辛巳日，抵达并州。三月丙午日，皇后在朝堂宴请亲戚、故旧、邻里，妇人在宫内殿中宴请，赏赐各有差别。皇帝下诏：“并州妇女年龄在八十岁以上的，授予郡君称号（以丝帛文书为凭证）。”
百济依仗高丽的援助，多次侵犯新罗；新罗王金春秋上表求救。辛亥日，任命左武卫大将军苏定方为神丘道行军大总管，率领左骁卫将军刘伯英等人水陆大军十万人讨伐百济。任命金春秋为嵎夷道行军总管，率领新罗军队，与苏定方大军协同作战。
夏季四月戊寅日，皇帝从并州出发；癸巳日，抵达东都。五月，修建合璧宫。壬戌日，皇帝前往合璧宫。
戊辰日，任命定襄都督阿史德枢宾、左武候将军延陀梯真、居延州都督李合珠同为冷岍道行军总管，各自率领本部军队讨伐反叛的奚族，同时命令尚书右丞崔馀庆担任使者，总领监护三路军队，奚族不久后派遣使者投降。又任命阿史德枢宾等人为沙砖道行军总管，讨伐契丹，擒获契丹松漠都督阿卜固，押送到东都。
六月庚午朔日，发生日食。
壬午日，皇帝返回洛阳宫。
房州刺史梁王李忠，年龄逐渐增长，内心颇为不安，有时私下穿上妇人衣服以防备刺客；又多次自己占卜吉凶。有人告发了这件事，秋季七月乙巳日，皇帝废黜李忠为平民，流放黔州，囚禁在李承乾原来的住宅中。
丁卯日，度支尚书、同中书门下三品卢承庆因征调赋税不当获罪，被免去官职。
八月，吐蕃禄东赞派遣儿子起政率军进攻吐谷浑，原因是吐谷浑归附唐朝。
苏定方率领军队从成山渡过大海，百济军队据守熊津江口抵抗。苏定方进军击败百济军，百济士兵死亡数千人，其余全部溃散逃走。苏定方水陆大军齐头并进，径直奔赴百济都城。距离都城二十余里时，百济倾尽全国兵力前来迎战，苏定方大败百济军，斩杀一万余人，追击敌军，进入都城外郭。百济王义慈及太子隆逃到北部边境，苏定方进军包围都城；义慈的次子泰自立为王，率领部众固守。隆的儿子文思说：“国王与太子都还在，叔父却仓促拥兵称王，即便能击退唐军，我们父子也必定性命不保。”于是率领亲信翻越城墙前来投降，百姓纷纷跟随，泰无法阻止。苏定方命令士兵登上城墙竖起旗帜，泰陷入困境，开门投降。于是义慈、隆及各城城主全部投降。百济原本分为五部，统领三十七郡、二百座城池、七十六万户人家，皇帝下诏在百济之地设置熊津等五个都督府，任命百济酋长为都督、刺史。
壬午日，左武卫大将军郑仁泰率领军队讨伐思结、拔也固、仆骨、同罗四部，三战三捷，追击一百余里，斩杀四部酋长后返回。
冬季十月，皇帝起初被风眩病困扰，头部沉重，眼睛无法看清东西，百官上奏政事，皇帝有时让皇后裁决。皇后性情聪慧机敏，涉猎文史书籍，处理事务都符合皇帝旨意。从此皇帝开始将政事委托给她，皇后的权力与皇帝相当。
十一月戊戌朔日，皇帝亲临则天门楼，接受百济俘虏，从百济王义慈以下全部赦免。苏定方前后攻灭三个国家，都生擒了他们的君主。大赦天下。
甲寅日，皇帝前往许州。十二月辛未日，在长社打猎。己卯日，返回东都。
壬午日，任命左骁卫大将军契苾何力为浿江道行军大总管，左武卫大将军苏定方为辽东道行军大总管，左骁卫将军刘伯英为平壤道行军大总管，蒲州刺史程名振为镂方道总管，率领军队分路进攻高丽。青州刺史刘仁轨因监督海运时船只沉没获罪，以平民身份从军效力。
龙朔元年辛酉（公元661年）
春季正月乙卯日，朝廷招募黄河南北、淮南六十七州的士兵，共得四万四千余人，前往平壤、镂方行营。戊午日，任命鸿胪卿萧嗣业为夫馀道行军总管，率领回纥等各部落军队前往平壤。
二月乙未晦日，更改年号为龙朔。
三月丙申朔日，皇帝与群臣及外族使者在洛城门宴饮，观看屯营新兵演练的舞蹈，称之为《一戎大定乐》。当时皇帝打算亲征高丽，用这个舞蹈象征用兵必胜的态势。
起初，苏定方平定百济后，留下郎将刘仁愿镇守百济府城，又任命左卫中郎将王文度为熊津都督，安抚百济残余部众。王文度渡海后去世，百济僧人道琛、原将领福信聚集部众占据周留城，从倭国迎回原王子丰并拥立他为王，率军将刘仁愿包围在府城。皇帝下诏起用刘仁轨为检校带方州刺史，率领王文度的部众，顺路征调新罗军队救援刘仁愿。刘仁轨高兴地说：“上天将要让我这个老头富贵了！”向州府请求《唐历》及皇室庙讳后出发，说：“我要扫平东夷，将大唐的历法颁布到海外！”刘仁轨治军严明整齐，转战前进，所到之处都被攻克。百济在熊津江口设立两道栅栏，刘仁轨与新罗军队联合进攻，攻破栅栏，杀死和淹死的百济士兵达一万余人。道琛等人于是解除对府城的包围，退守任存城；新罗军队粮草耗尽，领兵返回。道琛自称领军将军，福信自称霜岑将军，招集部众，势力更加壮大。刘仁轨兵力较少，与刘仁愿合兵一处，让士兵休息。上奏请求皇帝下诏让新罗出兵，新罗王金春秋奉诏，派遣将领金钦率领军队救援刘仁轨等人，抵达古泗时，遭到福信截击，金钦战败。金钦从葛岭道逃回新罗，不敢再出兵。不久福信杀死道琛，独自总领百济军队。
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