魏国人陈馀对孔子的后代孔鲋（字子鱼）说：“秦国将要毁灭先王的典籍，而您是这些书籍的主人，太危险了！”孔鲋说：“我钻研的是看似无用的学问，了解我的只有朋友。秦国不是我的朋友，我有什么危险呢？我将把书藏起来等待真正需要它的人；需要它的人来了，就没有祸患了。”
阿房宫与直道工程、始皇猜忌（公元前212年）?
始皇三十五年（己丑年，公元前212年）?
派蒙恬修筑直道（从咸阳向北直达边境的快速通道），从九原郡（今内蒙古包头）直到云阳（今陕西淳化），开山填谷长达一千八百里，几年都没有完工。
秦始皇觉得咸阳人口太多，先王留下的宫殿太小，于是下令在渭水南岸的上林苑中营建朝宫（朝会宫殿）。先修建前殿阿房宫，东西宽五百步，南北长五十丈，上面可以坐一万人，下面可以竖立五丈高的大旗。周围环绕着架空的阁道通道（周驰为阁道），从殿下一直通到南山（终南山），将南山峰顶作为宫阙的象征标志（表南山之颠以为阙）。又修筑复道（空中走廊），从阿房宫渡过渭水，连接到咸阳，用以象征天上从北极星（天极）经阁道星（阁道）横跨银河（汉）抵达营室星座的天象。征调受过宫刑（隐宫）的犯人和苦役犯（徒刑者）七十多万人，一部分去修建阿房宫，一部分去修建骊山陵墓。开采北山的石料做棺椁外椁（石椁），砍伐蜀地、楚地的木材，全都运到关中。关中共计有宫殿三百座，关外有四百多座。于是在东海边朐县（今江苏连云港）境内立石，作为秦朝的东大门。为此迁徙三万户人家到骊邑（今陕西临潼），五万户人家到云阳（今陕西淳化），都免除他们十年的赋税徭役（复不事十岁）。
卢生劝导秦始皇说：“这种方术认为：君主需要时常秘密出行（微行）以躲避恶鬼。恶鬼避开，真人（仙人）就会降临。希望皇上居住的宫殿不要让外人知道，这样长生不死之药大概就可以得到了。”秦始皇说：“我仰慕真人。”于是自称“真人”，不再称“朕”。下令将咸阳周围二百里内的二百七十座宫观，用复道和甬道连接起来，布满帷帐、钟鼓、美女，各自按登记的位置居住，不得移动。皇帝巡行所到之处，如果有人敢泄露他的处所，就判死罪。一次秦始皇到梁山宫（今陕西乾县西），从山上望见丞相（李斯）随从的车马很多，流露出不满。宫中侍从中有人告诉了丞相，丞相后来就减少了车骑随从。秦始皇发怒道：“这是宫中的人泄露了我的话！”于是审问当时在场的人，没人承认，就把当时在身旁的人全部抓起来杀了。从此以后，再没有人知道皇帝的行踪了。群臣有事情要皇帝决定的，都到咸阳宫等候。
坑儒事件（公元前212年）?
侯生、卢生逃亡与坑儒：?
侯生、卢生相互议论讥讽秦始皇，害怕获罪，于是逃走了。秦始皇听说后，勃然大怒：“我对卢生等人，尊重厚赐十分优厚，如今竟然诽谤我！咸阳的儒生们，我派人去查问过，其中有人制造妖言迷惑百姓。”于是命令御史（监察官）全面审问咸阳的儒生。儒生们互相告发牵连，秦始皇亲自判决了四百六十多个触犯禁令的人，把他们全部活埋在咸阳，（以此）昭告天下，惩戒后人；并再次增派罪犯流放边境。秦始皇的长子扶苏进谏说：“这些儒生都诵读效法孔子的学说。如今皇上都用重法治他们的罪，我担心天下会因此不安定。”秦始皇大怒，下令扶苏离开咸阳，北上到上郡去给蒙恬的军队担任监军。
秦始皇最后两年与沙丘之变（公元前211年 - 210年）?
始皇帝三十六年（庚寅年，公元前211年）?
东郡（今河南濮阳一带）天降陨石。有人在陨石上刻字：“始皇死而地分。”（秦始皇死后，国土将分裂）。秦始皇派御史去追查审问刻字之人，无人认罪；于是把陨石坠落处附近居住的人全部抓来杀掉，并烧毁了那块陨石。
（同年）将黄河以北榆中（今内蒙古鄂尔多斯一带）的三万户居民迁移到新开拓的地区；赏赐他们爵位一级。
始皇帝三十七年（辛卯年，公元前210年）?
冬季，十月，癸丑日，秦始皇出巡；左丞相李斯随行，右丞相冯去疾留守京城。秦始皇有二十多个儿子，小儿子胡亥最受宠爱，请求跟随出游；秦始皇答应了。
十一月，巡游队伍到达云梦泽（今湖北一带），在九疑山（今湖南南部）遥祭虞舜。然后乘船顺长江而下，经过籍柯（今地不详），渡过海渚（长江中的沙洲），经过丹杨（今安徽当涂东北），到达钱唐（今浙江杭州）。面对波涛汹涌的浙江（钱塘江），于是向西走了一百二十里，从一个狭窄的江面渡过。登上会稽山（今浙江绍兴东南），祭祀大禹，遥望南海（东中国海），立石刻碑颂扬自己的功德。返回途中，经过吴地（今江苏苏州），从江乘（今江苏句容北）渡江。然后沿着海岸北上，到达琅邪、之罘。在海上看见巨大的鱼（鲸），用箭射杀了它。于是沿海岸向西行进，到达平原津（今山东平原西南黄河渡口）时，秦始皇病倒了。
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