随后，冯异和寇恂就向刘秀发去了战报，将领们也都进帐祝贺，众人就乘机请求刘秀称帝。将军南阳人马武首先说：“大王您虽然总是谦恭退让，但国家宗庙社稷又能托付给谁呢？您应该先称帝，然后再讨论征讨的事。像现在名号未正，我们就东闯西杀的，到底谁是贼呢？”刘秀感到很吃惊，赶忙说：“将军怎么说出这种话来？这都够杀头的罪了！”于是就率军返回蓟县，随后又派了吴汉率领耿、景丹等十三位将军追击尤来等贼军，共斩首一万三千多人，最后一直追到浚靡县才返回。此时的贼军散入辽西、辽东，结果又被乌桓、貊人进行抢掠击杀，贼军几乎死光了。都护将军贾复同五校的贼军在真定进行交战，结果贾复身受重伤。听到消息的刘秀大吃一惊，说：“我之所以不让贾复独自率军，就是因为他容易轻敌。现在果然如我所料，我丧失了一员名将呀！我听说他妻子怀有身孕，将来如果生下的是女孩儿，就让我的儿子娶她为妻；如果生的男孩儿，就把我的女儿嫁给他。不要让他为妻子儿女担忧。”结果贾复的伤势不久就痊愈了，随后贾复在蓟县追上了刘秀，两人见面非常高兴。等刘秀回到中山县后，将领们就再次请求他称帝，但他再次拒绝了。等大军走到南平棘后，将领们再次坚决恳请他称帝，但他还是不答应。就在将领们都要退下的时候，耿纯却进谏说：“如今，天下的士大夫舍弃亲属，背井离乡，在箭雨之中跟随大王，他们一心向往的，本就是攀龙附凤，以完成自己的志向。现在您拖延称帝的时间，这就是在违背众意呀，如今您不确定尊号，我恐怕士大夫们会失去希望，到时无计可施，从而产生退归故里的想法，不会长期忍耐下去的。若是众人一散，想再聚合到一处就很难了。”耿纯的话说的非常诚恳殷切，刘秀对他也是十分感谢，就说：“我会好好考虑的。”
刘秀带着军队走到了鄗县，这时他就找来冯异，想了解当下的形势。冯异对刘秀说：“更始政权肯定是要完蛋的，如今复兴汉室的重任就落在您身上了，您就听大家的，赶紧称帝吧！”两人正说着呢，就有个叫强华的儒生从关中赶来，带来了一本叫《赤伏符》的书，上面写着刘秀起兵讨伐奸贼，天下英雄响应，汉朝也该重新建立了。大臣们一看，又开始劝刘秀称帝。到了六月二十二日，刘秀就在鄗县南边正式登基做皇帝，还改了年号，随后宣布大赦天下。
邓禹带着军队包围了安邑，但是打了好几个月都没打下来。就在这时，更始政权的大将军樊参带着好几万人从大阳渡过黄河，准备攻打邓禹。随后两军就在解县南边进行了一场激烈的厮杀，最终被杀樊参。就在邓禹刚取得胜利的时候，王匡、成丹、刘均又凑了十多万人马，前来攻打邓禹，结果邓禹就被打败了。到了二十六号这天，因为是六十甲子的最后一天，王匡他们就觉得这天不吉利，所以就没出兵，而是闭门休息。这就给了邓禹重新整顿队伍的机会。到了二十七日，王匡他们倾巢而出，邓禹却下令按兵不动，等到敌军靠近营垒后，才让将士们击鼓冲锋，一下子就把敌人打得落花流水。王匡他们眼看形势对自己不利，赶紧掉头就跑，随后邓禹就带人追击，最终杀了刘均和河东太守杨宝，又顺利的拿下了河东，而王匡他们只好灰溜溜的逃回长安。
还有张卬，他跟手下人商量说：“如今赤眉军马上就要打过来了，咱们肯定扛不住，不如在长安抢一笔，然后回南阳。要是实在不行，咱们就去当土匪！”这几个人就跑去劝刘玄，把刘玄气得脸都黑了，看到这情况，这几人就谁也不敢再吱声了。后来刘玄就让王匡、陈牧、成丹、赵萌在新丰驻扎，宰相李松在轵城屯兵，用来抵挡赤眉军。这时的张卬、廖湛、胡殷、申屠建和隗嚣又进行密谋，他们想趁着立秋祭祀宗庙的时候，劫持刘玄，实施之前的计划。刘玄知道后，就装病不上朝，还把张卬他们骗进宫，打算一网打尽。隗嚣就借口生病没去，还召集手下守住宅子。这时的刘玄犹犹豫豫下不了决心，结果张卬他们就察觉到了不对劲，于是撒腿就跑。申屠建反应慢，留在宫里被杀了。刘玄还让邓晔带人包围了隗嚣的宅子。这边张卬他们决定一不做二不休，放火烧了宫门，直接打进皇宫，结果刘玄被打得大败，隗嚣也趁机突围跑回了天水。第二天一早，刘玄就逃出了皇宫，投奔驻扎在新丰的赵萌。好不容易逃出来的刘玄又怀疑王匡、陈牧、成丹和张卬是一伙的，就把他们都叫来。陈牧和成丹先到的，当场就被杀了。王匡吓得赶紧带兵跑进长安，和张卬他们汇合了。
当赤眉军打到华阴的时候，队伍里有个从齐地来的巫师，就整天敲着鼓又唱又跳的，说是要祭祀城阳景王刘章。这巫师还神神叨叨地说：“景王生气啦，说‘要当就当正经天子，当什么盗贼！’”谁要是笑话这巫师，马上就会生病，一时间弄得整个军队人心惶惶。方望的弟弟方阳就劝樊崇他们说：“如今将军们手握百万大军，现在都快打到都城了，可还顶着个‘盗贼’的名号，这哪行啊？我们不如找个刘家的后代立为皇帝，然后打着天子的旗号行事，到时候谁还敢不听咱们的号令？”樊崇他们觉得这主意不错，而且那巫师的话也越来越玄乎。等军队开到郑县时，大家一合计：“现在都快到长安了，就连鬼神都这么暗示了，我们得赶紧找个刘家子孙，立他当皇帝！”
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