宣城内史桓彝听说京城失守，悲愤交加，泪流满面，随即领兵进驻泾县。当时很多州郡都派使者向苏峻投降，他的部下裨惠又劝桓彝，不如暂且和苏峻通使，来缓解眼前的灾祸。桓彝却坚定地说：“我蒙受国家深厚的恩德，按道义应当以死报国，怎么能忍辱和逆臣往来！就算最终不能成功，那也是我的命。”桓彝派将军俞纵驻守兰石，苏峻派部将韩晃前去攻打。俞纵的军队快要战败时，身边人劝他撤退，俞纵说：“我蒙受桓侯（桓彝）的厚恩，应当以死报答。我不能辜负桓侯，就像桓侯不辜负国家一样！”于是奋力作战，最终战死。韩晃进军攻打桓彝，六月，泾县城被攻陷，桓彝被俘，随后被杀害。
各路军队刚到石头城时，就想和苏峻决战，陶侃却冷静地说：“叛贼现在势头正盛，难以和他们硬拼，应当用时间和智谋来打败他们。”不久后，联军多次交战都没有取胜，监军部将李根请求修筑白石垒，陶侃同意了。士兵们连夜修筑堡垒，到天亮时就建成了。听到苏峻军队整队的鼓声，将领们都担心他们会来攻打白石垒。孔坦却镇定地说：“不会的。如果苏峻要攻打堡垒，必须等到东北风大起，让我们的水军没法前去救援；现在天气平静，叛贼肯定不会来。他们整队，必然是要派兵从江乘出发，去掠夺京口以东的地区。”没过多久，果然如孔坦所料。陶侃派庾亮率领两千人驻守白石垒，苏峻率领一万多步兵骑兵从四面围攻，最终没能攻克。
王舒、虞潭等人多次和苏峻的军队交战，都不顺利。孔坦说：“本来就不该召郗公（郗鉴）来这里，导致东边的防线毫无防备。现在应该派他回去，虽然晚了点，但总比不派好。”陶侃于是下令让郗鉴和后将军郭默返回占据京口，修筑大业、曲阿、庱亭三座堡垒，来分散苏峻的兵力，派郭默驻守大业垒。
壬辰日，雍州刺史魏该去世。
这时，祖约派祖涣、桓抚袭击湓口。陶侃听说后，准备亲自领兵去迎击。毛宝急忙劝阻：“义军全靠您坐镇，您不能轻易出动，请让我去讨伐他们！”陶侃同意了。祖涣、桓抚途经皖城时，趁机攻打谯国内史桓宣。毛宝率军前去救援，却被祖涣、桓抚打败。一支箭射中毛宝的大腿，穿透了马鞍，毛宝让人踩着马鞍拔出箭，鲜血浸透了靴子。他忍着剧痛反击祖涣、桓抚，最终把敌军打跑，桓宣这才得以突围，归附温峤。之后毛宝又进军东关攻打祖约的军队，攻占了合肥的戍守据点，恰逢温峤召他回军，便又返回石头城前线。
祖约的部将们暗中与后赵勾结，许诺做后赵的内应。后赵将领石聪、石堪率军渡过淮河，进攻寿春。秋季七月，祖约的军队全线溃败，他本人逃往历阳，石聪等人俘获了寿春两万多户百姓后撤军。
后赵中山公石虎率领四万部众从轵关向西进发，攻打前赵的河东郡。河东地区响应石虎的县城有五十多个，石虎随后进军围攻蒲阪。前赵君主刘曜派河间王刘述征调氐族、羌族部众驻守秦州，防备张骏和杨难敌，自己则率领朝廷内外的精锐水陆大军救援蒲阪，从卫关向北渡过黄河。石虎见状心生畏惧，便率军撤退。刘曜率军追击，八月，在高候追上石虎，随即与他展开激战，大败石虎军队，斩杀将领石瞻。战场上尸体连绵两百多里，刘曜缴获的军资器械数以亿计，石虎逃往朝歌。刘曜从大阳渡过黄河，攻打驻守金墉的石生，还掘开千金堨堤坝，用水灌城。他又分派将领攻打汲郡、河内，后赵的荥阳太守尹矩、野王太守张进等人纷纷投降。消息传到襄国，后赵朝廷上下大为震动。
此时，张骏整饬军队，想趁前赵空虚袭击长安。理曹郎中索询劝谏道：“刘曜虽然东征，但他的儿子刘胤驻守长安，不是轻易能对付的。就算咱们能获得一点小胜利，要是刘曜放弃东征，回头来和咱们交战，那灾祸的规模就难以估量了！”张骏于是放弃了这个打算。
这时，苏峻的亲信路永、匡术、贾宁听说祖约战败，担心苏峻的大事难以成功，就劝苏峻把司徒王导等大臣全部杀掉，重新培植自己的亲信。但苏峻一向敬重王导，所以没有同意。路永等人便对苏峻产生了二心，王导趁机派参军袁耽暗中引诱路永归顺朝廷。九月戊申日，王导带着两个儿子和路永一起逃往白石垒。袁耽是袁涣的曾孙。
陶侃、温峤等人与苏峻长期对峙，始终无法决出胜负。苏峻分派将领向东西两方攻掠，大多取得胜利，联军士兵人心惶惶。从建康逃到西军（联军）的朝廷官员都私下议论：“苏峻狡猾又有决断力，他的部下骁勇善战，所向无敌。要是靠上天讨伐有罪之人，苏峻最终会灭亡；但单从人力来看，实在不容易除掉他。”温峤听后怒不可遏，立马斥责道：“你们自己怯懦，竟然还去夸赞叛贼！”可后来联军多次交战失利，温峤自己也开始忌惮苏峻。
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