对此，司马光说：晋朝自从渡过长江以来，国威衰弱，戎狄横行，像猛虎一样吞噬中原。刘裕开始率领朝廷军队平定东方的敌国，却不在此时表彰贤才、礼遇俊杰，安抚疲惫的百姓，宣扬仁爱的风气，清除残暴的政令，让士人向往朝廷，遗民翘首期盼，反而肆意屠杀来发泄愤怒。看他的所作所为，连苻氏、姚氏（前秦、后秦）都比不上，难怪他不能统一天下、成就伟大的功业，这难道不是因为他虽有智慧和勇气，却没有仁义之心才导致的吗！
起初，徐道覆听说刘裕北伐南燕，便劝说卢循趁东晋后方空虚袭击建康，卢循没有听从。徐道覆亲自到番禺劝说卢循：“我们本来住在五岭以南，难道要在这里终老，把地盘传给子孙吗？只是因为刘裕难以对抗才这样。如今刘裕把军队驻扎在坚固的城池下，没有返回的日期，我们用这些渴望回归故土的敢死士兵袭击何无忌、刘毅等人，易如反掌。不抓住这个机会，反而苟且追求一时的安定，朝廷一直把您视为心腹大患；如果刘裕平定南燕后，休整军队一年多，用诏书征召您，他亲自率军驻守豫章，派遣将领率领精锐部队越过五岭，即使您有神武之才，恐怕也难以抵挡。现在的机会，千万不能错过。如果先攻克建康，摧毁朝廷的根基，刘裕即使南返，也无能为力了。您如果不同意，我就率领始兴的军队直接进攻寻阳。”卢循很不乐意采取这一行动，但又无法反驳徐道覆的计划，于是听从了他。
起初，徐道覆派人在南康山中砍伐造船的木材，运到始兴后低价出售，当地人争相购买，木材大量堆积，却没人怀疑他的意图；到这时，徐道覆把木材全部取回建造战船，十天就完成了。卢循从始兴出发侵犯长沙，徐道覆侵犯南康、庐陵、豫章，各地的守将和地方官都弃城逃跑。徐道覆顺江而下，战船和武器装备十分精良。
当时攻克南燕的消息还没传到建康，朝廷紧急征召刘裕回师。刘裕正商议留在下邳镇守，谋划夺取司州、雍州，恰逢收到诏书，于是任命韩范为都督八郡军事、燕郡太守，封融为勃海太守，檀韶为琅邪太守；二月二十六（戊申），率领军队返回。檀韶是檀祗的兄长。过了很久，刘穆之诬告韩范、封融谋反，把他们都杀了。
安成忠肃公何无忌从寻阳率领军队抵御卢循。长史邓潜之劝谏说：“国家的安危，就在这一战。听说卢循的战船众多，势力处于上游，应当挖开南塘的堤坝，坚守豫章、寻阳两座城池等待他们，他们一定不敢绕过我们远道东下。我们养精蓄锐，等他们疲惫不堪后再出击，这是万无一失的计策。现在把成败寄托在一战上，万一失利，后悔就来不及了！”参军殷阐说：“卢循率领的部众都是三吴地区的旧贼，身经百战仍有勇气，始兴的溪族士兵，身手敏捷、善于战斗，不能轻视。将军应当留驻豫章，向所属城池征兵，等兵力集中后再交战，还不算晚。如果用现在的兵力轻率进军，恐怕一定会后悔。”何无忌不听。三月二十（壬申），何无忌与徐道覆在豫章相遇，叛军命令数百名强弩手登上西岸的小山拦击晋军。恰逢西风猛烈，把何无忌乘坐的小船吹向东岸，叛军趁机用大战船逼近，晋军随即溃散。何无忌厉声喊道：“拿我的苏武节来！”符节送到后，他手持符节督战。叛军士兵云集，何无忌言辞神色毫无屈服，最终握着符节战死。于是朝廷内外震惊恐惧，大臣们商议想护送皇帝向北逃跑，投靠刘裕；不久得知叛军还没到建康，才停止这一计划。
这时，西秦王乞伏乾归攻打后秦的金城郡，攻克了该城。
夏王刘勃勃派遣尚书金纂攻打平凉。后秦王姚兴率军救援平凉，进攻金纂，将他杀死。刘勃勃又派遣侄子、左将军罗提攻克定阳，活埋后秦将士四千多人。后秦将领曹炽、曹云、王肆佛等人各自率领数千人逃往内地，姚兴把他们安置在湟山和陈仓。刘勃勃侵犯陇右，攻破白崖堡，随后进逼清水，略阳太守姚寿都弃城逃跑，刘勃勃把清水的一万六千户百姓迁徙到大城。姚兴从安定出发追击刘勃勃，追到寿渠川，没能追上，只好返回。
起初，南凉王秃发傉檀派遣左将军枯木等人讨伐沮渠蒙逊，劫掠临松一千多户百姓后返回。沮渠蒙逊讨伐南凉，抵达显美，迁徙数千户百姓后离去。南凉太尉俱延再次讨伐沮渠蒙逊，结果大败而回。这个月，秃发傉檀亲自率领五万骑兵讨伐沮渠蒙逊，双方在穷泉交战，秃发傉檀大败，独自骑马逃回。沮渠蒙逊乘胜进军包围姑臧，姑臧百姓因王钟被诛杀的事（此前王钟等人谋降后秦，被秃发傉檀处死），都惊慌溃散，一万多户夷族、汉族百姓投降沮渠蒙逊。秃发傉檀恐惧，连忙派遣司隶校尉敬归和儿子秃发佗到沮渠蒙逊那里做人质，请求讲和，沮渠蒙逊同意了。敬归走到胡坑时，趁机逃回，秃发佗被追兵抓获，沮渠蒙逊迁徙南凉八千多户百姓后离去。南凉右卫将军折掘奇镇占据石驴山反叛。秃发傉檀既害怕沮渠蒙逊的逼迫，又担心岭南被折掘奇镇占据，于是迁都到乐都，留下大司农成公绪镇守姑臧。秃发傉檀刚出城，魏安人侯谌等人就关闭城门作乱，聚集三千多家百姓，占据姑臧南城，推举焦朗为大都督、龙骧大将军，侯谌自称凉州刺史，向沮渠蒙逊投降。
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